More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1178 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  100 
 
 
269 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  92.57 
 
 
269 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  92.19 
 
 
269 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  93.05 
 
 
259 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  92.66 
 
 
259 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  92.66 
 
 
259 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  92.66 
 
 
259 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  92.28 
 
 
259 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0588  short chain dehydrogenase  79.92 
 
 
260 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194347  normal  0.0391008 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  79.15 
 
 
260 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  78.76 
 
 
260 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  78.76 
 
 
260 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2765  short chain dehydrogenase  80.31 
 
 
260 aa  394  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  77.99 
 
 
258 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  77.61 
 
 
258 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  74.9 
 
 
258 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0521  short chain dehydrogenase  78.76 
 
 
260 aa  390  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847891  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0545  short chain dehydrogenase  78.76 
 
 
259 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.074184  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4142  short chain dehydrogenase  60.67 
 
 
272 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553245  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3473  short chain dehydrogenase  53.52 
 
 
259 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3761  short chain dehydrogenase  54.3 
 
 
259 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  57.25 
 
 
269 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1022  short chain dehydrogenase  56.76 
 
 
261 aa  281  8.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.917277  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2753  short chain dehydrogenase  59.69 
 
 
265 aa  279  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.26681  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3597  short chain dehydrogenase  50 
 
 
259 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  56.49 
 
 
269 aa  275  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3774  short chain dehydrogenase  54.47 
 
 
258 aa  261  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
246 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.77 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
259 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
256 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.13 
 
 
250 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
262 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
260 aa  168  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
252 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
250 aa  168  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
252 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
251 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.16 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40 
 
 
246 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  41.83 
 
 
257 aa  165  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
252 aa  165  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.61 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.41 
 
 
247 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
257 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.34 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.18 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.8 
 
 
246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  40.24 
 
 
256 aa  162  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  39.53 
 
 
247 aa  162  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
265 aa  162  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  42.23 
 
 
251 aa  162  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
251 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
251 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  38.76 
 
 
250 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
246 aa  161  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
260 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.22175 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
256 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.51 
 
 
246 aa  160  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
270 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 
263 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.2 
 
 
246 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.2 
 
 
246 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.2 
 
 
246 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.2 
 
 
246 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2696  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.02 
 
 
260 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 
263 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.2 
 
 
246 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.2 
 
 
246 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
251 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 
263 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
256 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 
263 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 
263 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 
257 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
272 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  35.94 
 
 
256 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 
271 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3256  malate/L-lactate dehydrogenase  39.76 
 
 
247 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0180309  normal  0.2268 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.11 
 
 
246 aa  159  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3899  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.8 
 
 
246 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000498723  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.92 
 
 
261 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
260 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6971  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.69 
 
 
263 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 
247 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
260 aa  159  6e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
244 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.6 
 
 
246 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
256 aa  159  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
270 aa  158  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
248 aa  158  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
261 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.43 
 
 
248 aa  157  1e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>