More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0706 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
260 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.22175 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
258 aa  168  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 
269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 
269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  36.78 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  36.78 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0588  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 
260 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194347  normal  0.0391008 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  36.09 
 
 
260 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 
269 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 
258 aa  158  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 
258 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3473  short chain dehydrogenase  34 
 
 
259 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4142  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
272 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553245  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3761  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 
259 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3597  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  36.88 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  36.12 
 
 
269 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2765  short chain dehydrogenase  37.2 
 
 
260 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0521  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 
260 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847891  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0545  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 
259 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.074184  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3774  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
272 aa  140  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1022  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 
261 aa  138  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.917277  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1409  aldose dehydrogenase  32.96 
 
 
258 aa  136  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 
272 aa  135  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2753  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.26681  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.81 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
249 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1512  short chain dehydrogenase  32.4 
 
 
262 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0696  glucose 1-dehydrogenase  33.46 
 
 
252 aa  125  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
258 aa  125  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
282 aa  125  9e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.451543 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.9 
 
 
246 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.25 
 
 
246 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  30.68 
 
 
251 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  33.07 
 
 
261 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2137  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 
256 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.422468  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.45 
 
 
302 aa  122  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
249 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.3 
 
 
255 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
253 aa  118  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
251 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
258 aa  119  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3818  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.05 
 
 
245 aa  118  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0470155 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
271 aa  118  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.746633  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1896  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  31.05 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1175  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.41 
 
 
241 aa  115  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267366  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1462  short chain dehydrogenase  31.73 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780505  normal  0.472933 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.58 
 
 
248 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03085  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  33.33 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.727774  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  31.87 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.43 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  34.5 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2742  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0442377  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  32.27 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1364  putative glucose/ribitol dehydrogenase  33.98 
 
 
257 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.333439999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.25 
 
 
247 aa  113  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0669  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.41 
 
 
247 aa  113  3e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.154574  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1151  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.33 
 
 
234 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.256582 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
240 aa  113  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0904  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.85 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  32.4 
 
 
252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
252 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
254 aa  112  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2072  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
247 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000027021  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 
273 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19021  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>