More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4142 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4142  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  61.09 
 
 		 258 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  62.65 
 
 		 258 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  62.79 
 
 		 259 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  61.28 
 
 		 269 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  62.4 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  62.4 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  62.4 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  62.4 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  60.9 
 
 		 269 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  61.87 
 
 		 258 aa  321  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  60.67 
 
 		 269 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  58.37 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0588  short chain dehydrogenase  58.91 
 
 		 260 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194347  normal  0.0391008 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  58.91 
 
 		 260 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  58.91 
 
 		 260 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0545  short chain dehydrogenase  60.47 
 
 		 259 aa  301  9e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.074184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2765  short chain dehydrogenase  60.23 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0521  short chain dehydrogenase  59.69 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1022  short chain dehydrogenase  55.77 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.917277  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3597  short chain dehydrogenase  53.15 
 
 		 259 aa  282  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  52.36 
 
 		 269 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3761  short chain dehydrogenase  52.34 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3473  short chain dehydrogenase  51.56 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  51.27 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2753  short chain dehydrogenase  51.87 
 
 		 265 aa  269  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.26681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3774  short chain dehydrogenase  52.94 
 
 		 258 aa  268  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  37.2 
 
 		 251 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 263 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 263 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 263 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 263 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 263 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 248 aa  168  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  37.55 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 252 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 256 aa  165  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 250 aa  165  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  37.05 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 		 246 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  38.58 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  36.25 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0429275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.94 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.74 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 251 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.162923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 282 aa  158  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.69 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.8 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  33.86 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 		 245 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.679351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.65 
 
 		 249 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  36.25 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.89 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.98 
 
 		 247 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  38.04 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.932836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>