More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3761 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3761  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 259 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3473  short chain dehydrogenase  95.75 
 
 		 259 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3597  short chain dehydrogenase  73.36 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  55.47 
 
 		 259 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  55.08 
 
 		 269 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  55.08 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  55.08 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  55.08 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  55.08 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  55.08 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  54.12 
 
 		 258 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0588  short chain dehydrogenase  54.83 
 
 		 260 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194347  normal  0.0391008 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  54.05 
 
 		 260 aa  295  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  54.83 
 
 		 260 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  54.83 
 
 		 260 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  54.3 
 
 		 269 aa  292  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  53.33 
 
 		 258 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4142  short chain dehydrogenase  52.34 
 
 		 272 aa  280  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  52.55 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2765  short chain dehydrogenase  54.83 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0545  short chain dehydrogenase  54.47 
 
 		 259 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.074184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0521  short chain dehydrogenase  53.67 
 
 		 260 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1022  short chain dehydrogenase  48.43 
 
 		 261 aa  262  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.917277  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  47.88 
 
 		 269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  47.66 
 
 		 269 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3774  short chain dehydrogenase  44.36 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2753  short chain dehydrogenase  45.7 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.26681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 260 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  40.48 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  40.48 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  40.48 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  40.48 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  40.48 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.46 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.391136 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.29 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  39.29 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.86 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 		 252 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  35.97 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.51 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  39.61 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.46 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.25 
 
 		 247 aa  155  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.66 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 330 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.66 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000407954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.32 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560297 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 		 260 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.22175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  35.41 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 255 aa  151  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  35.41 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 		 262 aa  150  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.92 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759988  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.86 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>