More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0471 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85.94 
 
 
256 aa  444  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.11 
 
 
256 aa  441  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358595  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.34 
 
 
257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  51.38 
 
 
258 aa  275  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.51 
 
 
256 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  52.57 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  52.34 
 
 
254 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.69 
 
 
261 aa  270  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.718128 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  51.95 
 
 
254 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.76 
 
 
254 aa  266  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  51.79 
 
 
255 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 
257 aa  261  6.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
255 aa  261  8.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.02 
 
 
272 aa  260  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.21 
 
 
255 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  51.2 
 
 
251 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1576  gluconate 5-dehydrogenase  49.03 
 
 
289 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1470  gluconate 5-dehydrogenase  48.64 
 
 
254 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1800  gluconate 5-dehydrogenase  48.64 
 
 
254 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  49.81 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  50.6 
 
 
256 aa  253  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.18 
 
 
257 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.58 
 
 
269 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4747  gluconate 5-dehydrogenase  48.06 
 
 
254 aa  249  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04132  gluconate 5-dehydrogenase  48.06 
 
 
254 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.06 
 
 
254 aa  249  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4522  gluconate 5-dehydrogenase  48.06 
 
 
254 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0305607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04096  hypothetical protein  48.06 
 
 
254 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5032  gluconate 5-dehydrogenase  51.2 
 
 
252 aa  249  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4263  gluconate 5-dehydrogenase  46.15 
 
 
263 aa  249  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.39 
 
 
257 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.39 
 
 
257 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0349  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.42 
 
 
257 aa  247  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  47.86 
 
 
254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0222  gluconate 5-dehydrogenase  45.7 
 
 
254 aa  244  9e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.58 
 
 
255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4887  gluconate 5-dehydrogenase  45.74 
 
 
254 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4831  gluconate 5-dehydrogenase  46.12 
 
 
254 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
253 aa  240  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4738  gluconate 5-dehydrogenase  45.74 
 
 
254 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120281 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4768  gluconate 5-dehydrogenase  45.74 
 
 
254 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136475  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4868  gluconate 5-dehydrogenase  45.74 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.113188 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5798  gluconate 5-dehydrogenase  50.8 
 
 
251 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  hitchhiker  0.00243591 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0949  gluconate 5-dehydrogenase  46.12 
 
 
264 aa  239  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161447 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.17 
 
 
255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.808003  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.62 
 
 
265 aa  232  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2534  gluconate 5-dehydrogenase  45.17 
 
 
262 aa  231  7.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1164  gluconate 5-dehydrogenase  44.88 
 
 
263 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0620  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.8 
 
 
255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1904  gluconate 5-dehydrogenase  42.31 
 
 
270 aa  217  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0490  gluconate 5-dehydrogenase  41.15 
 
 
265 aa  215  7e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
274 aa  211  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
257 aa  205  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7371  short-chain alcohol dehydrogenase  47.04 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  43.15 
 
 
258 aa  193  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
255 aa  191  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2646  phosphatidylserine decarboxylase  41.94 
 
 
258 aa  186  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.229989  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.64 
 
 
251 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0922  Short-chain alcohol dehydrogenase  41.83 
 
 
256 aa  185  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000799282  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 
254 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.203579  normal  0.799434 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  41.67 
 
 
254 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
254 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0537  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  42 
 
 
256 aa  181  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  43.15 
 
 
251 aa  181  9.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1909  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  41.37 
 
 
253 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00371976  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01160  LSDR, putative  37.27 
 
 
293 aa  179  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
262 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
260 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
254 aa  178  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0873  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  41.77 
 
 
253 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0848  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  41.77 
 
 
253 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5663  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  43.82 
 
 
251 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363313  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2989  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  41.77 
 
 
253 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0709919  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2990  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  42.06 
 
 
253 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.916776  normal  0.048185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2202  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.56 
 
 
253 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0416  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.48 
 
 
245 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.73 
 
 
255 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
256 aa  176  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3164  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  42.06 
 
 
253 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4111  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  42.06 
 
 
253 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000566262 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1716  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.73 
 
 
253 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.1 
 
 
249 aa  176  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0344  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.53 
 
 
258 aa  175  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1897  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.04 
 
 
245 aa  175  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114593 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
251 aa  175  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00521448  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
254 aa  175  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0672528  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.966986 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3515  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.55 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0468  gluconate 5-dehydrogenase  40.87 
 
 
251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6604  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  43.03 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4949  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220607  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.936397  normal  0.224474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2207  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  45.1 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0118  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.2 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  41.6 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>