More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3759 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3759  oxidoreductase  100 
 
 		 257 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.108381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2002  oxidoreductase  99.22 
 
 		 257 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1536  oxidoreductase  98.05 
 
 		 257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1563  oxidoreductase  94.55 
 
 		 257 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.256146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1904  oxidoreductase  86.17 
 
 		 255 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1670  oxidoreductase  87.04 
 
 		 272 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0171077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3809  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  85 
 
 		 241 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2709  oxidoreductase  78.12 
 
 		 258 aa  411  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34130  oxidoreductase  74.19 
 
 		 260 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2027  oxidoreductase  77.55 
 
 		 255 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.274157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23950  oxidoreductase  76.73 
 
 		 255 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.08 
 
 		 254 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.96 
 
 		 262 aa  278  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.83 
 
 		 256 aa  275  5e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.03 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.33 
 
 		 249 aa  255  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0696  glucose 1-dehydrogenase  52.8 
 
 		 252 aa  248  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1364  putative glucose/ribitol dehydrogenase  53.85 
 
 		 257 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.333439999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 		 267 aa  236  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.48 
 
 		 249 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675189  normal  0.198967 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03085  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  50.4 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 		 306 aa  217  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 		 256 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.81 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 		 252 aa  208  6e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.184681  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.22 
 
 		 299 aa  208  6e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.87 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.22 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 		 254 aa  204  8e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.63 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 		 249 aa  195  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.523448  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0904  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.53 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0926  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.92 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1912  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.387305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.32 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.879762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.43 
 
 		 266 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05160  oxidoreductase  34.39 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.06 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.40468  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  40.56 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 		 250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3692  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31077  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.46 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.18 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  35.97 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4004  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132038  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  34.66 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  37.05 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 		 275 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0214725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.06 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 		 267 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.239754  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  37.05 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  36.65 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  35.97 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0620  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.25 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.890979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 		 241 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  38.43 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 269 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  35.97 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0755029  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3752  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.32 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.999176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  33.86 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  33.73 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  33.33 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>