More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2086 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 245 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.21 
 
 		 244 aa  178  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 		 245 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 		 245 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 		 245 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  38.66 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.24 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 239 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  37.97 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.5 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 250 aa  124  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  40.25 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  30.93 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5080  short chain dehydrogenase  39.51 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 237 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 237 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  31.36 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  37.56 
 
 		 204 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  38.66 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  33.91 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 237 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 249 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  35.41 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.75 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 		 248 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 		 250 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.345333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  32.13 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.87 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.268207  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 		 274 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 		 249 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.6 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.33 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 		 250 aa  95.5  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 258 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.872863 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  31.2 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  34.03 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  34.31 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  26.23 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  34.16 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  34.16 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 255 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 		 270 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0156103  normal  0.420839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>