More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06495 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  100 
 
 		 222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.44 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  43.26 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  34.03 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 		 250 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  37 
 
 		 237 aa  141  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  37.12 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  41.21 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  37.12 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  37.12 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  37.12 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  37.12 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  32.35 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  41.4 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  41.21 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  41.21 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  32.02 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5080  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 240 aa  104  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 259 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3131  short chain dehydrogenase  36 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.72 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3326  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 246 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2298  glucose-1-dehydrogenase  36.65 
 
 		 253 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1035  glucose-1-dehydrogenase  36.13 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 244 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1859  glucose-1-dehydrogenase  35.08 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1103  glucose-1-dehydrogenase  35.08 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0386  glucose-1-dehydrogenase  35.08 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1270  glucose-1-dehydrogenase  35.08 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151441  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1263  glucose-1-dehydrogenase  35.08 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.859357  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0763  glucose-1-dehydrogenase  35.08 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1663  glucose-1-dehydrogenase  36.13 
 
 		 253 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 256 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2275  glucose-1-dehydrogenase  36.13 
 
 		 253 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 256 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5602  glucose-1-dehydrogenase  36.13 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  26.45 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1408  glucose-1-dehydrogenase  35.08 
 
 		 271 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2191  glucose-1-dehydrogenase  35.6 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2313  glucose-1-dehydrogenase  35.08 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 274 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 247 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2032  glucose-1-dehydrogenase  35.6 
 
 		 248 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.569693  normal  0.784384 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1318  glucose-1-dehydrogenase  35.08 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573048  normal  0.212962 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1003  glucose-1-dehydrogenase  35.08 
 
 		 253 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  34.55 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.13 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2004  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.108608  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 		 249 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.49 
 
 		 259 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.58 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0860852  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195415  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2504  glucose-1-dehydrogenase  32.98 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.95 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4327  putative short chain dehydrogenase  44.32 
 
 		 140 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.93 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3613  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2520  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0216463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5629  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00973208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2493  short chain dehydrogenase  30.41 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1726  short chain dehydrogenase  29.38 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>