More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1859 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1859  glucose-1-dehydrogenase  100 
 
 		 252 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0763  glucose-1-dehydrogenase  100 
 
 		 252 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0386  glucose-1-dehydrogenase  100 
 
 		 252 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1103  glucose-1-dehydrogenase  100 
 
 		 252 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1270  glucose-1-dehydrogenase  99.6 
 
 		 252 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151441  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1263  glucose-1-dehydrogenase  99.6 
 
 		 252 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.859357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1408  glucose-1-dehydrogenase  99.21 
 
 		 271 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1035  glucose-1-dehydrogenase  94.05 
 
 		 261 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2191  glucose-1-dehydrogenase  86.06 
 
 		 253 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1003  glucose-1-dehydrogenase  87.04 
 
 		 253 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2313  glucose-1-dehydrogenase  86.23 
 
 		 253 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2298  glucose-1-dehydrogenase  84.21 
 
 		 253 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1663  glucose-1-dehydrogenase  84.62 
 
 		 253 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2275  glucose-1-dehydrogenase  84.62 
 
 		 253 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5602  glucose-1-dehydrogenase  85.02 
 
 		 253 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1318  glucose-1-dehydrogenase  79.67 
 
 		 248 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573048  normal  0.212962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  79.27 
 
 		 248 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2032  glucose-1-dehydrogenase  76.83 
 
 		 248 aa  359  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.569693  normal  0.784384 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2504  glucose-1-dehydrogenase  69.92 
 
 		 248 aa  328  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2004  short chain dehydrogenase  61.54 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.108608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23650  short chain dehydrogenase  61.54 
 
 		 248 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0188614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1253  glucose-1-dehydrogenase  67.62 
 
 		 247 aa  298  7e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.38 
 
 		 248 aa  297  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.4 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2772  glucose-1-dehydrogenase  66.67 
 
 		 248 aa  292  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2368  glucose-1-dehydrogenase  66.67 
 
 		 248 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.445485  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.32 
 
 		 249 aa  292  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.6 
 
 		 242 aa  291  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.57 
 
 		 248 aa  289  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124334  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.71 
 
 		 251 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.98 
 
 		 248 aa  284  9e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0254  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.98 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.818245  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0397  oxidoreductase  55.28 
 
 		 248 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3909  hypothetical protein  54.47 
 
 		 248 aa  271  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.65 
 
 		 247 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0807  hypothetical protein  52.65 
 
 		 247 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.540927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3527  oxidoreductase  60.64 
 
 		 250 aa  271  9e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.72 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0908582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.87 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.994157  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02734  predicted NAD(P)-binding oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  52.65 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3229  hypothetical protein  52.65 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02697  hypothetical protein  52.65 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3061  hypothetical protein  52.65 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3323  hypothetical protein  52.24 
 
 		 247 aa  265  4e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.91 
 
 		 248 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2526  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.69 
 
 		 248 aa  265  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.28 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3547  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  56.28 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.765075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.47 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0371739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.87 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.858408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1409  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.01 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.57 
 
 		 250 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2487  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.25 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147298  normal  0.672807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.1 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00539118  normal  0.224466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2758  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  53.25 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0263508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000874  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  51.63 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.01 
 
 		 248 aa  252  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2376  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.44 
 
 		 248 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3141  short chain dehydrogenase  55.47 
 
 		 248 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3321  hypothetical protein  50.61 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.5 
 
 		 248 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.28 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139142  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.24 
 
 		 253 aa  248  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2158  glucose 1-dehydrogenase  51.43 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3521  oxidoreductase  52.85 
 
 		 253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0095  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 		 249 aa  245  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1482  glucose 1-dehydrogenase  51 
 
 		 250 aa  244  8e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.350696  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.97 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0185509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06849  hypothetical protein  49.19 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2688  putative short-chain dehydrogenase/reductase  50.2 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.6 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00171075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.73 
 
 		 245 aa  241  7.999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.24 
 
 		 246 aa  241  7.999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185736  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.76 
 
 		 250 aa  241  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.68 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0012  putative short-chain dehydrogenase  49.8 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.891592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.36 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0396102  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.87 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195415  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.75 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.88009  normal  0.487287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.98 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0860852  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.52 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.04 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.580093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.39 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.02 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0871917  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.12 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.67 
 
 		 248 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 		 249 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.31 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00973208  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 248 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 		 248 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 		 248 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>