More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5629 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5629  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4312  short chain dehydrogenase  55.28 
 
 		 199 aa  215  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1238  short chain dehydrogenase  53.06 
 
 		 199 aa  205  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50610  short chain dehydrogenase  52.26 
 
 		 223 aa  204  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0391945 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3138  short chain dehydrogenase  50.76 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0313  short chain dehydrogenase  50.77 
 
 		 199 aa  197  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0297  short chain dehydrogenase  50.77 
 
 		 199 aa  197  6e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4284  short chain dehydrogenase  47.45 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0613  short chain dehydrogenase  47.45 
 
 		 201 aa  195  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0886445 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4448  short chain dehydrogenase  47.45 
 
 		 201 aa  188  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0927  short chain dehydrogenase  45.5 
 
 		 200 aa  188  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1664  short chain dehydrogenase  47.21 
 
 		 199 aa  188  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06295  short chain dehydrogenase  45.23 
 
 		 200 aa  187  8e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0657  short chain dehydrogenase  45.73 
 
 		 202 aa  184  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3331  short chain dehydrogenase  49.75 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05280  short chain dehydrogenase  45.18 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2493  short chain dehydrogenase  48.48 
 
 		 200 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3526  short chain dehydrogenase  52.63 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1726  short chain dehydrogenase  48.48 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3200  short chain dehydrogenase  47.47 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5475  short chain dehydrogenase  45.23 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5387  short chain dehydrogenase  45.23 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4883  short chain dehydrogenase  44.22 
 
 		 202 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2512  short chain dehydrogenase  45.92 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296656  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3670  short chain dehydrogenase  42 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3793  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0789  short chain dehydrogenase  39.5 
 
 		 205 aa  148  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4306  short chain dehydrogenase  37.88 
 
 		 197 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl362  short chain dehydrogenase  43.07 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.68833e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3613  short chain dehydrogenase  39.8 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2520  short chain dehydrogenase  39.09 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0216463  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1873  short chain dehydrogenase  41.33 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6188  short chain dehydrogenase  40.51 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2619  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1736  short chain dehydrogenase  41.33 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.157452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1778  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  35.48 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  32.02 
 
 		 245 aa  71.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  30.68 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  29.23 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  28.24 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  32.77 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 		 248 aa  62  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  31.93 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  31.93 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  31.93 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.92 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  30.95 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.9 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0847  short chain dehydrogenase/reductase family protein  27.37 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.42 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2074  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.43 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.53 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170949  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  29.61 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  26.01 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1914  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.5 
 
 		 240 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.41 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 		 238 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  27.7 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10628  short chain dehydrogenase  24.72 
 
 		 239 aa  52.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.5 
 
 		 258 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 247 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3542  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 		 249 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0247071  normal  0.033589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 		 250 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.48 
 
 		 245 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3939  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 		 282 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.41 
 
 		 238 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  24 
 
 		 249 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2783  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.48 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.79 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 250 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.56 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.49 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  27.01 
 
 		 252 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.79 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2523  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  29.11 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  31.54 
 
 		 690 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.71 
 
 		 249 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>