More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1605 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 690 aa  1402    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  39.35 
 
 		 698 aa  456  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 		 657 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 		 657 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  35.39 
 
 		 688 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  35.24 
 
 		 688 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  32.02 
 
 		 706 aa  331  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  29.49 
 
 		 689 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  33.71 
 
 		 696 aa  327  6e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  31.57 
 
 		 705 aa  317  7e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 		 701 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  31.65 
 
 		 705 aa  311  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  32.07 
 
 		 707 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  33.1 
 
 		 684 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  32.39 
 
 		 699 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 		 701 aa  310  8e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 		 694 aa  309  9e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  32.13 
 
 		 653 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 680 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 		 705 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  34.67 
 
 		 664 aa  308  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 		 707 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  30.59 
 
 		 703 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 		 691 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  32.19 
 
 		 682 aa  299  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 		 705 aa  296  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  31.68 
 
 		 705 aa  296  1e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 		 700 aa  295  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  32.69 
 
 		 715 aa  294  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  29.7 
 
 		 698 aa  293  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  31.27 
 
 		 705 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  32.18 
 
 		 700 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  31.89 
 
 		 683 aa  288  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  30.74 
 
 		 698 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 		 689 aa  283  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 		 677 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 677 aa  281  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 677 aa  281  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  30.2 
 
 		 713 aa  280  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  30.81 
 
 		 706 aa  278  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  29.79 
 
 		 698 aa  277  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  32.99 
 
 		 676 aa  275  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  32.17 
 
 		 685 aa  275  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  29.78 
 
 		 705 aa  272  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.41 
 
 		 726 aa  272  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  31.92 
 
 		 680 aa  271  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  31.63 
 
 		 707 aa  270  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  31.64 
 
 		 680 aa  270  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 		 677 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 		 677 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 691 aa  268  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  32.24 
 
 		 702 aa  267  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  30.37 
 
 		 701 aa  266  8.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 		 695 aa  265  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.69 
 
 		 678 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  31.07 
 
 		 679 aa  257  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  31.3 
 
 		 700 aa  252  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 		 652 aa  253  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  29.17 
 
 		 729 aa  246  6.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  30.33 
 
 		 687 aa  246  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  29.36 
 
 		 730 aa  246  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  32.45 
 
 		 705 aa  244  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  29.01 
 
 		 730 aa  243  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  29.45 
 
 		 729 aa  238  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  29.93 
 
 		 684 aa  233  8.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  32.43 
 
 		 571 aa  207  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  36.77 
 
 		 413 aa  204  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  36.3 
 
 		 413 aa  201  5e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 246 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 244 aa  99.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 		 253 aa  98.2  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.01 
 
 		 256 aa  97.8  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 247 aa  97.4  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  29.66 
 
 		 261 aa  97.4  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 		 260 aa  95.9  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35072  normal  0.362703 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0303  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  30.68 
 
 		 262 aa  95.9  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 		 249 aa  94.7  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 256 aa  94.4  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 		 246 aa  93.6  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 		 248 aa  92.8  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  28.9 
 
 		 259 aa  92.8  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 		 258 aa  92.8  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 263 aa  92.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.37 
 
 		 260 aa  92.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.62 
 
 		 270 aa  92.4  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4158  acetoin reductase  30.5 
 
 		 257 aa  92.4  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 276 aa  92  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 		 254 aa  91.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  29.66 
 
 		 257 aa  91.7  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0363  sorbitol dehydrogenase  29.7 
 
 		 257 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.94 
 
 		 249 aa  91.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 		 266 aa  91.7  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 		 255 aa  91.3  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 		 245 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.08 
 
 		 269 aa  90.9  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 		 249 aa  90.5  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.41 
 
 		 257 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.7 
 
 		 246 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.59 
 
 		 246 aa  90.1  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 246 aa  89.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.934127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>