More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3625 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  50.5 
 
 		 713 aa  667    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  52.59 
 
 		 706 aa  676    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  52.94 
 
 		 701 aa  695    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  77.03 
 
 		 685 aa  1031    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  77.23 
 
 		 676 aa  1018    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  78.19 
 
 		 678 aa  1037    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 687 aa  1370    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  53.96 
 
 		 707 aa  702    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  75.52 
 
 		 683 aa  1028    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  78.19 
 
 		 677 aa  1017    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  78.61 
 
 		 691 aa  1060    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  78.78 
 
 		 677 aa  1052    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  78.41 
 
 		 689 aa  1069    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  52.13 
 
 		 707 aa  701    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  77.6 
 
 		 679 aa  1021    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  76.71 
 
 		 680 aa  1023    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  78.78 
 
 		 677 aa  1052    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  77.96 
 
 		 684 aa  1015    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  79.08 
 
 		 677 aa  1060    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  74.74 
 
 		 680 aa  1001    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  78.93 
 
 		 677 aa  1046    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  49.34 
 
 		 699 aa  623  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  49.78 
 
 		 698 aa  615  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  47.79 
 
 		 703 aa  603  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  47.42 
 
 		 698 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  48.08 
 
 		 698 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  48.3 
 
 		 700 aa  587  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  49.41 
 
 		 700 aa  554  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  46.88 
 
 		 702 aa  549  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  45.8 
 
 		 707 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  47 
 
 		 705 aa  528  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  43.6 
 
 		 730 aa  527  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  43.16 
 
 		 729 aa  518  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  43.48 
 
 		 730 aa  512  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  43.55 
 
 		 680 aa  514  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 		 726 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  37.68 
 
 		 689 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  42.01 
 
 		 694 aa  481  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  41.31 
 
 		 729 aa  473  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 		 701 aa  474  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  44.13 
 
 		 700 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.21 
 
 		 691 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  42.36 
 
 		 696 aa  441  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.41 
 
 		 695 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  35.1 
 
 		 684 aa  299  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  32.49 
 
 		 705 aa  296  9e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  33.83 
 
 		 688 aa  289  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 		 688 aa  286  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  31.36 
 
 		 705 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  31.65 
 
 		 705 aa  284  5.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  32.58 
 
 		 706 aa  283  8.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  32.12 
 
 		 705 aa  283  9e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  32.08 
 
 		 705 aa  281  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  31.19 
 
 		 653 aa  281  3e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 701 aa  280  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  31.77 
 
 		 705 aa  280  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  30.56 
 
 		 657 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  30.56 
 
 		 657 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  31.53 
 
 		 705 aa  269  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  32.49 
 
 		 682 aa  261  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  34.32 
 
 		 652 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  31.43 
 
 		 690 aa  258  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  32.23 
 
 		 715 aa  256  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  32.69 
 
 		 664 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  31.2 
 
 		 698 aa  239  9e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 		 413 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 		 413 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  26.88 
 
 		 571 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 		 257 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 		 257 aa  135  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 		 262 aa  134  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  36.96 
 
 		 259 aa  134  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 261 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  45.65 
 
 		 249 aa  130  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 260 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 262 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.21 
 
 		 260 aa  129  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 275 aa  127  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 		 262 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.365337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 262 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  35.66 
 
 		 265 aa  126  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 260 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  40.21 
 
 		 251 aa  125  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1837  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.33 
 
 		 258 aa  125  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00311801  normal  0.334735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 		 262 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 262 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.33 
 
 		 266 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 263 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.5 
 
 		 270 aa  122  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 		 256 aa  122  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 254 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 256 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 256 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 		 267 aa  121  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 256 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 		 249 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 269 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 268 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 270 aa  120  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 		 249 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>