More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3516 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  51.58 
 
 		 657 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  51.58 
 
 		 657 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 664 aa  1333    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  51.6 
 
 		 652 aa  590  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  43.73 
 
 		 653 aa  555  1e-156  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  37.52 
 
 		 682 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  35.79 
 
 		 705 aa  360  4e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 		 705 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  34.13 
 
 		 706 aa  344  4e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  38.29 
 
 		 571 aa  342  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  37.68 
 
 		 698 aa  342  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  36.17 
 
 		 684 aa  340  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 		 689 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  33.66 
 
 		 705 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 		 680 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 		 705 aa  335  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 		 690 aa  327  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 		 688 aa  327  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 		 694 aa  327  4.0000000000000003e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 		 688 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  33.52 
 
 		 701 aa  325  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  33.56 
 
 		 705 aa  324  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  33.29 
 
 		 705 aa  316  8e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  33.95 
 
 		 705 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 		 701 aa  313  7.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  36.16 
 
 		 695 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 		 691 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  34.08 
 
 		 715 aa  304  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  35.62 
 
 		 696 aa  303  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  31.65 
 
 		 707 aa  293  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  31.57 
 
 		 707 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  31.51 
 
 		 701 aa  289  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  30.81 
 
 		 699 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  31.97 
 
 		 703 aa  288  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  30.59 
 
 		 706 aa  284  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  31.27 
 
 		 698 aa  281  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 		 689 aa  280  6e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  32.52 
 
 		 700 aa  279  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 676 aa  279  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  33.62 
 
 		 700 aa  278  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  30.57 
 
 		 730 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 		 678 aa  269  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  30.48 
 
 		 713 aa  268  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.27 
 
 		 726 aa  267  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  31.59 
 
 		 698 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  31.92 
 
 		 677 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 		 680 aa  264  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  33.43 
 
 		 679 aa  263  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  32.4 
 
 		 683 aa  262  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  29.79 
 
 		 729 aa  263  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  33.23 
 
 		 687 aa  262  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 		 677 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 		 677 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  30.88 
 
 		 698 aa  259  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  40.05 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 		 730 aa  259  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  32.22 
 
 		 677 aa  257  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  39.81 
 
 		 413 aa  257  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 		 700 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  31.42 
 
 		 680 aa  247  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 		 685 aa  246  6.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  32.17 
 
 		 691 aa  246  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  31.9 
 
 		 702 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 		 684 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 		 677 aa  238  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  32.42 
 
 		 705 aa  234  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  30.99 
 
 		 707 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  28.06 
 
 		 729 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  30.16 
 
 		 259 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2468  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.54 
 
 		 254 aa  107  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 254 aa  103  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.44826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 		 248 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.58 
 
 		 277 aa  101  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 		 253 aa  101  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.534255 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 		 267 aa  101  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.49838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.45 
 
 		 254 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 247 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0708885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20330  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 281 aa  100  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 253 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 269 aa  99  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  30.95 
 
 		 249 aa  99  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 		 256 aa  98.2  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 		 256 aa  98.2  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 		 256 aa  98.2  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 		 245 aa  97.8  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 		 252 aa  97.4  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.890933  normal  0.0516654 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3769  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.74 
 
 		 259 aa  97.4  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3481  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.26 
 
 		 259 aa  96.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 		 292 aa  95.9  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 		 251 aa  95.9  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 		 252 aa  95.9  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 		 252 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 		 253 aa  95.5  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 256 aa  95.1  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1271  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.66 
 
 		 258 aa  94.7  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 256 aa  95.1  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 256 aa  95.1  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 256 aa  95.1  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 256 aa  95.1  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 256 aa  95.1  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>