More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2254 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  57.29 
 
 		 680 aa  766    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 691 aa  1398    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  54.99 
 
 		 701 aa  741    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  52.69 
 
 		 689 aa  753    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  55.95 
 
 		 694 aa  745    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  52.94 
 
 		 700 aa  659    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  67.73 
 
 		 696 aa  867    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  63.45 
 
 		 695 aa  804    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  46.32 
 
 		 703 aa  618  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  46.79 
 
 		 699 aa  612  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  45.89 
 
 		 698 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  45.6 
 
 		 698 aa  591  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  45.74 
 
 		 698 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  45.16 
 
 		 700 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  44.36 
 
 		 707 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  46.12 
 
 		 700 aa  529  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  41.43 
 
 		 707 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 		 701 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  45.13 
 
 		 702 aa  509  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  40.25 
 
 		 713 aa  492  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 		 707 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  44.57 
 
 		 705 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  39.72 
 
 		 706 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 		 680 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.41 
 
 		 689 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  41.01 
 
 		 683 aa  473  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  41.63 
 
 		 676 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  40.65 
 
 		 678 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  41.24 
 
 		 691 aa  469  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  41.12 
 
 		 677 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  40.62 
 
 		 677 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 		 680 aa  463  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  36.93 
 
 		 730 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  37.57 
 
 		 729 aa  458  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  38.16 
 
 		 730 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  39.38 
 
 		 685 aa  455  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  42.16 
 
 		 677 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  40.62 
 
 		 677 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  40.62 
 
 		 677 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  41.21 
 
 		 687 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  41.05 
 
 		 679 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 		 726 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  39.35 
 
 		 684 aa  439  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  36.45 
 
 		 729 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 		 705 aa  375  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  35.13 
 
 		 705 aa  365  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 		 705 aa  364  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  35.24 
 
 		 684 aa  363  4e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 		 705 aa  361  3e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 		 688 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  34.07 
 
 		 705 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  34.67 
 
 		 706 aa  356  6.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 		 688 aa  354  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 		 698 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  33.93 
 
 		 705 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 		 653 aa  354  4e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  34.12 
 
 		 682 aa  353  8.999999999999999e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 		 705 aa  346  7e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 		 657 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 		 657 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  34.82 
 
 		 701 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  33.53 
 
 		 690 aa  334  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  34.75 
 
 		 664 aa  324  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  30.93 
 
 		 715 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  33.53 
 
 		 652 aa  276  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  29.65 
 
 		 571 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 		 413 aa  200  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  32.32 
 
 		 413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  37.98 
 
 		 259 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.47 
 
 		 260 aa  137  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 		 254 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 		 257 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 257 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.33 
 
 		 260 aa  132  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  35.61 
 
 		 247 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  35.23 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 265 aa  130  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02396  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.55 
 
 		 261 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 		 267 aa  127  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4270  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.86 
 
 		 261 aa  127  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149446  normal  0.650814 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  34.1 
 
 		 265 aa  127  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4380  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.86 
 
 		 261 aa  127  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209201  normal  0.21753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 		 253 aa  127  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 		 256 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3572  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  32.03 
 
 		 259 aa  126  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.50859 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2986  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.85 
 
 		 259 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.0453568 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3021  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.85 
 
 		 259 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000377349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2955  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.85 
 
 		 259 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3037  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.85 
 
 		 259 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3144  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.85 
 
 		 259 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2828  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  34.24 
 
 		 259 aa  124  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.4 
 
 		 260 aa  124  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 		 276 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02555  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.85 
 
 		 259 aa  124  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.896117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 259 aa  123  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0916994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1007  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.85 
 
 		 259 aa  124  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250387  hitchhiker  0.000000447457 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 		 257 aa  123  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02520  hypothetical protein  33.85 
 
 		 259 aa  124  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2989  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.85 
 
 		 259 aa  123  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2841  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.46 
 
 		 259 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>