More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5807 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  52.9 
 
 		 701 aa  741    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  88.52 
 
 		 703 aa  1279    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  53.54 
 
 		 713 aa  739    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  52.5 
 
 		 707 aa  751    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  61.56 
 
 		 705 aa  778    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  71.35 
 
 		 700 aa  1016    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  73.52 
 
 		 699 aa  1062    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  71.76 
 
 		 700 aa  950    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  85.82 
 
 		 698 aa  1220    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  63.97 
 
 		 707 aa  854    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  96.28 
 
 		 698 aa  1379    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 698 aa  1423    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  43.87 
 
 		 689 aa  635    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  50.87 
 
 		 706 aa  697    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  51.71 
 
 		 707 aa  741    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  62.08 
 
 		 702 aa  818    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  49.71 
 
 		 689 aa  633  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  50.52 
 
 		 677 aa  615  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  49.56 
 
 		 683 aa  616  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  49.34 
 
 		 679 aa  612  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  49.41 
 
 		 680 aa  611  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  45.63 
 
 		 730 aa  609  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  45.91 
 
 		 730 aa  612  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  45.91 
 
 		 729 aa  607  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  46.74 
 
 		 680 aa  598  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  48.3 
 
 		 685 aa  596  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  47.19 
 
 		 677 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  46.89 
 
 		 677 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  46.89 
 
 		 677 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  47.64 
 
 		 676 aa  595  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  48 
 
 		 680 aa  585  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  47.27 
 
 		 678 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  48.09 
 
 		 684 aa  582  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  48.08 
 
 		 687 aa  581  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  48.3 
 
 		 677 aa  581  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  46.91 
 
 		 691 aa  579  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  44.11 
 
 		 729 aa  574  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  43.6 
 
 		 726 aa  570  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  45.74 
 
 		 691 aa  568  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  45.38 
 
 		 694 aa  561  1e-158  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  46.33 
 
 		 696 aa  558  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  42.98 
 
 		 701 aa  548  1e-154  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  46.11 
 
 		 695 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  46.62 
 
 		 700 aa  535  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  33.28 
 
 		 698 aa  331  3e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 		 684 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  32.23 
 
 		 701 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  31.06 
 
 		 705 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  32.43 
 
 		 705 aa  305  3.0000000000000004e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 		 705 aa  296  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  29.97 
 
 		 705 aa  295  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  29.49 
 
 		 705 aa  293  9e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  30.84 
 
 		 690 aa  292  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  32.76 
 
 		 653 aa  292  2e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  29.36 
 
 		 705 aa  290  4e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  29.93 
 
 		 705 aa  290  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  31.64 
 
 		 657 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  31.64 
 
 		 657 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  32.01 
 
 		 682 aa  287  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  29.82 
 
 		 706 aa  281  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  31.38 
 
 		 688 aa  278  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 		 688 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  31.59 
 
 		 664 aa  260  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  30.85 
 
 		 715 aa  240  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  31.39 
 
 		 652 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 		 571 aa  195  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  28.87 
 
 		 413 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  28.64 
 
 		 413 aa  167  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  38.4 
 
 		 259 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 		 257 aa  135  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  35.85 
 
 		 265 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 		 257 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.47 
 
 		 266 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 		 256 aa  127  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 		 256 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 		 256 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.62 
 
 		 260 aa  125  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 261 aa  123  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.86 
 
 		 260 aa  123  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 		 266 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 252 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 261 aa  121  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877905  normal  0.0437007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 		 254 aa  120  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.425319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5564  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.36 
 
 		 260 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 		 261 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 		 267 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 		 266 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.476329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 		 256 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 260 aa  118  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 262 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 		 259 aa  119  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.74 
 
 		 260 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1368  short chain dehydrogenase  33.9 
 
 		 263 aa  117  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.694726 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 277 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 		 256 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 254 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.41 
 
 		 270 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 270 aa  115  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  33.33 
 
 		 247 aa  115  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>