More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1895 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 698 aa  1422    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  39.35 
 
 		 690 aa  468  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  33.72 
 
 		 703 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  35.01 
 
 		 657 aa  364  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  35.01 
 
 		 657 aa  364  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 		 694 aa  360  7e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 		 701 aa  355  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  33.97 
 
 		 698 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  34.81 
 
 		 705 aa  351  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  32.9 
 
 		 699 aa  349  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  35.73 
 
 		 705 aa  346  7e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  31.86 
 
 		 680 aa  345  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  32.7 
 
 		 698 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  34.81 
 
 		 705 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  34.37 
 
 		 682 aa  342  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  37.68 
 
 		 664 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  34.79 
 
 		 691 aa  342  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  35.39 
 
 		 684 aa  339  8e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  35.3 
 
 		 705 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  33.28 
 
 		 698 aa  337  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  34.06 
 
 		 700 aa  337  5.999999999999999e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 		 653 aa  336  9e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 		 696 aa  330  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  35.07 
 
 		 700 aa  330  6e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  30.48 
 
 		 689 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  33.29 
 
 		 705 aa  327  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 706 aa  323  6e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  33.95 
 
 		 705 aa  323  6e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 		 688 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 		 688 aa  318  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  34.76 
 
 		 701 aa  317  6e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  33 
 
 		 705 aa  311  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  33.43 
 
 		 707 aa  308  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  33.52 
 
 		 715 aa  298  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  29.93 
 
 		 701 aa  293  7e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 		 700 aa  293  8e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  30.52 
 
 		 713 aa  292  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  29.75 
 
 		 707 aa  291  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  29.57 
 
 		 707 aa  291  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 		 652 aa  287  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 		 695 aa  285  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  28.82 
 
 		 706 aa  280  8e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 		 702 aa  278  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 		 676 aa  259  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 		 683 aa  258  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  30.79 
 
 		 677 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 		 689 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 		 684 aa  253  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  30.56 
 
 		 687 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  31.87 
 
 		 705 aa  249  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  31.14 
 
 		 680 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  28.65 
 
 		 726 aa  248  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  27.75 
 
 		 730 aa  248  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  32.51 
 
 		 680 aa  248  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  32.08 
 
 		 685 aa  245  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.89 
 
 		 678 aa  242  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  32.27 
 
 		 691 aa  241  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  27.89 
 
 		 729 aa  240  5.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  27.51 
 
 		 730 aa  238  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  31.63 
 
 		 679 aa  232  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  30.67 
 
 		 677 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 		 677 aa  231  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  30.52 
 
 		 677 aa  229  9e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  30.52 
 
 		 677 aa  229  9e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  27.02 
 
 		 729 aa  228  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  30.71 
 
 		 571 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  34.32 
 
 		 413 aa  194  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  34.32 
 
 		 413 aa  193  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  35.74 
 
 		 259 aa  122  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 		 262 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.34 
 
 		 261 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.94 
 
 		 265 aa  113  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 		 258 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.23 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  32.31 
 
 		 263 aa  110  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.95 
 
 		 254 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 280 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1507  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.62 
 
 		 257 aa  110  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0183743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 		 260 aa  110  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2857  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.35 
 
 		 265 aa  109  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0938  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.12 
 
 		 261 aa  109  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.94 
 
 		 252 aa  109  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.54 
 
 		 277 aa  109  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0520  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.07 
 
 		 262 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1436  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.99 
 
 		 257 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.45 
 
 		 264 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.45 
 
 		 264 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.45 
 
 		 264 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.08 
 
 		 256 aa  108  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 253 aa  108  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 		 262 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 		 273 aa  107  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3073  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.08 
 
 		 256 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.789258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 250 aa  107  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19210  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.7 
 
 		 243 aa  107  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.62 
 
 		 261 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.62 
 
 		 261 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 278 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.779609  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 		 268 aa  105  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.56 
 
 		 261 aa  105  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>