More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3046 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  77.23 
 
 		 687 aa  1003    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  50.59 
 
 		 706 aa  664    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  74.45 
 
 		 684 aa  961    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  78.49 
 
 		 677 aa  1005    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  75.89 
 
 		 678 aa  1008    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  50.8 
 
 		 713 aa  668    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  77.84 
 
 		 689 aa  1047    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  75.82 
 
 		 683 aa  1024    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  76.14 
 
 		 691 aa  1005    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  76.75 
 
 		 677 aa  1022    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  78.81 
 
 		 677 aa  1046    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  76.75 
 
 		 677 aa  1025    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  52.14 
 
 		 707 aa  694    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  77.13 
 
 		 680 aa  1020    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  75 
 
 		 685 aa  991    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  53.93 
 
 		 701 aa  696    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  74.11 
 
 		 680 aa  993    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  78.24 
 
 		 679 aa  1007    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  51.98 
 
 		 707 aa  679    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  76.75 
 
 		 677 aa  1022    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 676 aa  1348    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  49.71 
 
 		 699 aa  631  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  49.05 
 
 		 698 aa  613  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  48.53 
 
 		 703 aa  615  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  48.6 
 
 		 700 aa  604  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  47.79 
 
 		 698 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  47.64 
 
 		 698 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  49.85 
 
 		 702 aa  570  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  47.88 
 
 		 700 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  45.69 
 
 		 726 aa  538  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  46.65 
 
 		 707 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  44.35 
 
 		 730 aa  528  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  47.65 
 
 		 705 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  44.11 
 
 		 729 aa  524  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  43.4 
 
 		 730 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 		 689 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  41.27 
 
 		 680 aa  486  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  41.8 
 
 		 729 aa  476  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  43.38 
 
 		 694 aa  474  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  42.63 
 
 		 701 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.6 
 
 		 691 aa  457  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  44.17 
 
 		 700 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  42.94 
 
 		 696 aa  442  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  40.95 
 
 		 695 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 		 705 aa  303  9e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  32.71 
 
 		 705 aa  297  4e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  33.93 
 
 		 682 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 		 705 aa  287  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 688 aa  280  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 		 684 aa  279  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  31.99 
 
 		 705 aa  277  4e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 		 688 aa  277  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 664 aa  275  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  31.71 
 
 		 705 aa  274  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  31.29 
 
 		 705 aa  273  6e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 706 aa  272  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 		 705 aa  272  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  33.14 
 
 		 690 aa  271  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 		 701 aa  261  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  30.01 
 
 		 657 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  30.01 
 
 		 657 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 		 698 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 		 715 aa  249  9e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  27.78 
 
 		 653 aa  249  2e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  32.4 
 
 		 652 aa  230  8e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  32.26 
 
 		 413 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  32.26 
 
 		 413 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  27.41 
 
 		 571 aa  170  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 		 257 aa  141  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.55 
 
 		 257 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 		 268 aa  136  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 261 aa  134  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 260 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 262 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4652  short chain dehydrogenase  39.33 
 
 		 264 aa  130  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109281  normal  0.0540489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 262 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 		 262 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6250  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 		 258 aa  128  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 263 aa  128  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 262 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 274 aa  126  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 263 aa  126  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2468  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 254 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 250 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 		 257 aa  125  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 267 aa  125  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.93 
 
 		 253 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.534255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 		 262 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.72 
 
 		 266 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 270 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 		 268 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 		 253 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 260 aa  121  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.071685 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06450  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01040)  33.97 
 
 		 247 aa  121  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  35.02 
 
 		 259 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 		 262 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  35.55 
 
 		 251 aa  121  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2308  putative 3-oxoacyl-ACP reductase  37.45 
 
 		 252 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 246 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 		 269 aa  118  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>