More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1972 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  70.07 
 
 		 705 aa  1014    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  73.65 
 
 		 706 aa  1072    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  76.88 
 
 		 701 aa  1087    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  68.94 
 
 		 705 aa  994    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 705 aa  1443    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  47.66 
 
 		 684 aa  643    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  85.11 
 
 		 705 aa  1233    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  74.75 
 
 		 705 aa  1085    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  68.23 
 
 		 705 aa  1008    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  84.96 
 
 		 705 aa  1227    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  44.37 
 
 		 688 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  44.51 
 
 		 688 aa  565  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  42.45 
 
 		 682 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  41.55 
 
 		 715 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  35.4 
 
 		 657 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  35.4 
 
 		 657 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 		 689 aa  362  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 		 653 aa  360  5e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  33.24 
 
 		 694 aa  332  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  35.3 
 
 		 691 aa  332  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  31.86 
 
 		 699 aa  330  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  31.53 
 
 		 680 aa  327  4.0000000000000003e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  35.09 
 
 		 698 aa  323  5e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  30.68 
 
 		 698 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  33.66 
 
 		 664 aa  316  7e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 		 701 aa  315  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  31.65 
 
 		 690 aa  310  5.9999999999999995e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  30.25 
 
 		 703 aa  308  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  33.52 
 
 		 700 aa  308  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  34.58 
 
 		 696 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  30.66 
 
 		 707 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 		 701 aa  305  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  30.8 
 
 		 707 aa  302  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  31.73 
 
 		 713 aa  301  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  31.06 
 
 		 698 aa  301  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  30.5 
 
 		 700 aa  298  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 		 726 aa  298  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 707 aa  298  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  31.36 
 
 		 706 aa  292  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 		 698 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 		 695 aa  285  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  29.61 
 
 		 729 aa  277  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  31.73 
 
 		 702 aa  275  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 		 652 aa  273  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 		 679 aa  269  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  29.07 
 
 		 678 aa  269  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  31.12 
 
 		 683 aa  266  7e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  30.96 
 
 		 700 aa  266  8.999999999999999e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  31.29 
 
 		 676 aa  266  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  35.49 
 
 		 413 aa  264  4e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 		 413 aa  263  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  30.4 
 
 		 677 aa  263  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  31.5 
 
 		 687 aa  262  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  30.68 
 
 		 677 aa  260  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  30.68 
 
 		 677 aa  260  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  31.36 
 
 		 691 aa  259  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  27.55 
 
 		 730 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  29.91 
 
 		 685 aa  255  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  27.54 
 
 		 730 aa  253  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 		 689 aa  253  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 		 677 aa  253  7e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  26.55 
 
 		 729 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  29 
 
 		 680 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 680 aa  246  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  29.68 
 
 		 705 aa  241  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  29.93 
 
 		 677 aa  233  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 		 684 aa  231  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 571 aa  230  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 249 aa  120  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 254 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 254 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.425319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 249 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 265 aa  107  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 269 aa  107  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 		 252 aa  107  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 		 248 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 249 aa  104  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.46 
 
 		 260 aa  103  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5564  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.94 
 
 		 260 aa  103  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  32.45 
 
 		 253 aa  103  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 		 291 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60014  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 		 249 aa  103  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 		 254 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.49 
 
 		 259 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.791092  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 247 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.01 
 
 		 258 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5536  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 		 262 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 270 aa  101  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.68 
 
 		 266 aa  100  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 249 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 		 246 aa  99.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 		 258 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2264  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.57 
 
 		 260 aa  99  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2236  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.57 
 
 		 260 aa  99  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.14 
 
 		 260 aa  98.2  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 		 252 aa  98.2  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 		 271 aa  97.4  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 		 263 aa  97.4  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.393265  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 		 258 aa  97.4  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.31 
 
 		 254 aa  97.1  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>