More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0705 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  100 
 
 
680 aa  1394    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  53.78 
 
 
700 aa  681    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  57.31 
 
 
691 aa  737    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  55.14 
 
 
694 aa  734    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  59.77 
 
 
696 aa  745    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  56.97 
 
 
695 aa  692    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  55.75 
 
 
701 aa  749    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  58.85 
 
 
689 aa  866    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  48.37 
 
 
703 aa  632  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  46.74 
 
 
698 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  47.26 
 
 
700 aa  601  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  45.8 
 
 
699 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  47.33 
 
 
698 aa  598  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  46.74 
 
 
698 aa  591  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  42.25 
 
 
707 aa  544  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  44.05 
 
 
677 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  44.05 
 
 
677 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  44.05 
 
 
677 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  45.83 
 
 
700 aa  528  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  42.28 
 
 
701 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
689 aa  521  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  45.63 
 
 
705 aa  518  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  43.19 
 
 
680 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  42.13 
 
 
730 aa  512  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  42.07 
 
 
729 aa  511  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  44.53 
 
 
702 aa  509  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  42.42 
 
 
683 aa  507  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  42.73 
 
 
677 aa  508  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  41.32 
 
 
713 aa  503  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  43.47 
 
 
679 aa  505  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  43.55 
 
 
687 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 
730 aa  501  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 
685 aa  501  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  42.13 
 
 
678 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 
707 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  43.57 
 
 
707 aa  498  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  41.34 
 
 
691 aa  498  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  40.9 
 
 
726 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 
684 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  44.02 
 
 
677 aa  495  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  41.64 
 
 
680 aa  491  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  41.27 
 
 
676 aa  488  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 
706 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  39.89 
 
 
729 aa  462  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  34.14 
 
 
705 aa  352  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 
705 aa  341  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  31.97 
 
 
705 aa  342  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 
657 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 
657 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  32.63 
 
 
705 aa  340  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  32.76 
 
 
705 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  31.53 
 
 
705 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  31.86 
 
 
698 aa  335  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  32.29 
 
 
706 aa  331  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  33.23 
 
 
684 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 
653 aa  329  8e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  32.19 
 
 
705 aa  329  9e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 
682 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 
688 aa  329  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
701 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 
688 aa  324  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 
664 aa  322  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 
690 aa  314  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  31.1 
 
 
715 aa  278  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 
652 aa  273  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  35.01 
 
 
413 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 
413 aa  212  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  28.94 
 
 
571 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  37.31 
 
 
259 aa  160  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
257 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.68 
 
 
260 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.29 
 
 
257 aa  153  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.31 
 
 
260 aa  153  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.92 
 
 
260 aa  153  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
265 aa  151  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5564  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.02 
 
 
260 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2411  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.02 
 
 
260 aa  143  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.520745  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3144  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.59 
 
 
259 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2986  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.59 
 
 
259 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.0453568 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3037  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.59 
 
 
259 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2955  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.59 
 
 
259 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3021  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.59 
 
 
259 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000377349 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2129  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.4 
 
 
262 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213864  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5865  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.4 
 
 
262 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2236  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.4 
 
 
262 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2212  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.4 
 
 
262 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2841  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  32.82 
 
 
259 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 
262 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4526  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.02 
 
 
261 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.129874  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3125  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.02 
 
 
261 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5146  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.02 
 
 
261 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3572  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  32.55 
 
 
259 aa  134  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.50859 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5713  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.02 
 
 
261 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110704  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
267 aa  134  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02555  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.43 
 
 
259 aa  134  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.896117  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02520  hypothetical protein  32.43 
 
 
259 aa  134  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1007  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  32.43 
 
 
259 aa  134  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250387  hitchhiker  0.000000447457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1961  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.26 
 
 
265 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.616628  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  34.72 
 
 
247 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1065  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.02 
 
 
262 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>