More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2436 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  71.37 
 
 		 703 aa  1044    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  54.35 
 
 		 701 aa  752    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  71.51 
 
 		 698 aa  1032    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 		 689 aa  641    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  73.43 
 
 		 699 aa  1070    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  62.57 
 
 		 705 aa  794    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  80.43 
 
 		 700 aa  1154    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  71.14 
 
 		 698 aa  1036    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  63.68 
 
 		 707 aa  828    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  52.89 
 
 		 707 aa  763    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  52.16 
 
 		 706 aa  722    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  53.9 
 
 		 707 aa  763    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  53.23 
 
 		 713 aa  732    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  71.76 
 
 		 698 aa  1024    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 700 aa  1437    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  60.89 
 
 		 702 aa  803    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  50.87 
 
 		 680 aa  629  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  44.3 
 
 		 689 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  49.04 
 
 		 683 aa  625  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  48.45 
 
 		 677 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  48.74 
 
 		 677 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  48.45 
 
 		 677 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  50.3 
 
 		 679 aa  615  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  49.34 
 
 		 685 aa  617  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  49.34 
 
 		 676 aa  615  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  49.78 
 
 		 677 aa  615  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  45.83 
 
 		 680 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  48.6 
 
 		 691 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  48.89 
 
 		 680 aa  604  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  49.34 
 
 		 677 aa  599  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  48.75 
 
 		 684 aa  599  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  48.16 
 
 		 678 aa  597  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  49.11 
 
 		 687 aa  597  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  44.49 
 
 		 730 aa  595  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  43.79 
 
 		 730 aa  580  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  45.71 
 
 		 694 aa  570  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  42.92 
 
 		 729 aa  568  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  46.9 
 
 		 696 aa  556  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  44.52 
 
 		 701 aa  555  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  46.32 
 
 		 691 aa  554  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  43.13 
 
 		 729 aa  551  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  47.86 
 
 		 700 aa  550  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.77 
 
 		 726 aa  547  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  47.13 
 
 		 695 aa  530  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 		 698 aa  333  6e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  32.9 
 
 		 705 aa  330  5.0000000000000004e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  32.41 
 
 		 701 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 706 aa  321  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  33.53 
 
 		 653 aa  319  1e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  30.91 
 
 		 705 aa  318  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  33 
 
 		 657 aa  317  5e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  33 
 
 		 657 aa  317  5e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  34.03 
 
 		 684 aa  317  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  31.3 
 
 		 705 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  30.96 
 
 		 705 aa  310  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  30.39 
 
 		 705 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  31.7 
 
 		 682 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  29.72 
 
 		 705 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 		 705 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 		 690 aa  295  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 		 688 aa  287  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  31.39 
 
 		 688 aa  283  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  31.21 
 
 		 664 aa  275  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 		 652 aa  241  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  29.14 
 
 		 715 aa  233  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  29.28 
 
 		 571 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 		 413 aa  191  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 		 413 aa  190  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  38.31 
 
 		 259 aa  151  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  35.23 
 
 		 265 aa  141  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.82 
 
 		 266 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.78 
 
 		 260 aa  137  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.4 
 
 		 260 aa  134  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 		 252 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 		 247 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5077  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 		 263 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.181934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4692  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 		 263 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.45 
 
 		 260 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4778  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 		 263 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 		 256 aa  129  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5564  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.23 
 
 		 260 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 		 256 aa  129  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 		 256 aa  129  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 264 aa  127  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 262 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 257 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5284  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 		 263 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 261 aa  126  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1368  short chain dehydrogenase  35.59 
 
 		 263 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.694726 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13592  short chain dehydrogenase  35.55 
 
 		 262 aa  125  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000955112  normal  0.120371 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 		 261 aa  125  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 260 aa  125  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 		 257 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 262 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 270 aa  124  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0019  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.08 
 
 		 261 aa  124  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 		 256 aa  123  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 		 256 aa  124  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2038  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.08 
 
 		 262 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.34 
 
 		 258 aa  123  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>