More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0887 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  74.56 
 
 
678 aa  1009    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  74.78 
 
 
677 aa  1006    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  48.84 
 
 
713 aa  647    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  76.57 
 
 
685 aa  1023    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  80.41 
 
 
677 aa  1080    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  100 
 
 
684 aa  1369    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  76.79 
 
 
689 aa  1045    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  74.6 
 
 
680 aa  1001    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  74.45 
 
 
676 aa  981    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  73.93 
 
 
677 aa  974    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  80.41 
 
 
677 aa  1078    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  52.34 
 
 
701 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  51.38 
 
 
707 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  77.16 
 
 
691 aa  1026    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  75.26 
 
 
680 aa  1016    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  77.96 
 
 
687 aa  1016    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  49.06 
 
 
706 aa  642    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  80.41 
 
 
677 aa  1078    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  73.93 
 
 
683 aa  1013    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  74.96 
 
 
679 aa  1005    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  52.91 
 
 
707 aa  711    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  48.55 
 
 
699 aa  628  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  48.83 
 
 
703 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  48.31 
 
 
698 aa  611  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  48.9 
 
 
700 aa  610  1e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  48.09 
 
 
698 aa  600  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  48.09 
 
 
698 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  48.31 
 
 
700 aa  552  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  47.59 
 
 
702 aa  540  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  45.49 
 
 
707 aa  521  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  42.44 
 
 
730 aa  512  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  42.58 
 
 
729 aa  511  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  46.35 
 
 
705 aa  510  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  41.72 
 
 
680 aa  504  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  43.12 
 
 
726 aa  501  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  41.88 
 
 
730 aa  501  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  41.19 
 
 
729 aa  474  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  41.73 
 
 
694 aa  467  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 
689 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.34 
 
 
701 aa  457  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  42.88 
 
 
700 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  39.35 
 
 
691 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  40.64 
 
 
696 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.2 
 
 
695 aa  409  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  32.24 
 
 
705 aa  288  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  32.69 
 
 
688 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 
688 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  33.43 
 
 
684 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  30.76 
 
 
657 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  30.76 
 
 
657 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 
705 aa  263  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  31.54 
 
 
705 aa  262  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  32.01 
 
 
682 aa  259  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  29 
 
 
705 aa  253  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  31.59 
 
 
701 aa  251  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  30.55 
 
 
706 aa  249  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  29.37 
 
 
653 aa  247  4e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  30.22 
 
 
690 aa  247  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  33.92 
 
 
652 aa  247  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  30.56 
 
 
705 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  31.22 
 
 
698 aa  242  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  29.96 
 
 
705 aa  241  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  29.94 
 
 
705 aa  240  8e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  31.32 
 
 
664 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  29.4 
 
 
715 aa  223  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
413 aa  170  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 
413 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  27.04 
 
 
571 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
270 aa  139  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
257 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 
257 aa  130  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
262 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  35.94 
 
 
251 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.7 
 
 
267 aa  126  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
262 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
274 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6250  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
258 aa  120  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
246 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
247 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.807678  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
262 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 
254 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
280 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
268 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
261 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
260 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
265 aa  119  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
262 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
256 aa  118  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06450  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01040)  33.21 
 
 
247 aa  118  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
262 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
269 aa  117  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
263 aa  117  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
253 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
246 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16790  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  37.11 
 
 
253 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.821391 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
254 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
255 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
260 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
249 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.999176  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
262 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>