More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1303 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 729 aa  1497    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  72.35 
 
 		 730 aa  1061    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  70.15 
 
 		 729 aa  1040    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  71.39 
 
 		 730 aa  1053    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  63.29 
 
 		 726 aa  927    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  45.59 
 
 		 707 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  45.44 
 
 		 703 aa  605  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  45.33 
 
 		 699 aa  599  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  45.84 
 
 		 700 aa  600  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  44.34 
 
 		 707 aa  601  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  44.52 
 
 		 698 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  44.8 
 
 		 698 aa  592  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  44.13 
 
 		 706 aa  590  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  44.52 
 
 		 698 aa  586  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  43.81 
 
 		 701 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  43.42 
 
 		 713 aa  585  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  45.99 
 
 		 707 aa  539  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  45.44 
 
 		 702 aa  535  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  43.69 
 
 		 700 aa  519  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  45.17 
 
 		 705 aa  516  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 		 677 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 		 677 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 		 677 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  38.68 
 
 		 689 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 		 689 aa  491  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  41.17 
 
 		 683 aa  488  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  42.6 
 
 		 685 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  42.52 
 
 		 676 aa  479  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.43 
 
 		 678 aa  478  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  40.03 
 
 		 680 aa  477  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  41.88 
 
 		 680 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  41.13 
 
 		 679 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  41.32 
 
 		 691 aa  465  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  40.76 
 
 		 677 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  40.76 
 
 		 680 aa  463  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  41.75 
 
 		 687 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.49 
 
 		 684 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.04 
 
 		 677 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  38.26 
 
 		 694 aa  433  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  36.64 
 
 		 691 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  36.4 
 
 		 701 aa  418  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  37.17 
 
 		 696 aa  396  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 700 aa  389  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  38.93 
 
 		 695 aa  373  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 		 705 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  31.63 
 
 		 705 aa  302  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  31.19 
 
 		 705 aa  289  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  29.61 
 
 		 705 aa  287  5.999999999999999e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  29.06 
 
 		 705 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 706 aa  274  5.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  29.61 
 
 		 705 aa  273  8.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  29.66 
 
 		 705 aa  271  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  29.03 
 
 		 701 aa  267  5e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  29.58 
 
 		 688 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  29.44 
 
 		 688 aa  255  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  27.26 
 
 		 653 aa  251  3e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  27.52 
 
 		 657 aa  250  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  27.52 
 
 		 657 aa  250  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 682 aa  246  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  29.99 
 
 		 690 aa  244  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  29.47 
 
 		 684 aa  242  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  28.78 
 
 		 715 aa  227  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  27.72 
 
 		 698 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  28.24 
 
 		 664 aa  216  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  28.18 
 
 		 571 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  26.35 
 
 		 652 aa  174  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  29.16 
 
 		 413 aa  173  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  28.93 
 
 		 413 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 257 aa  103  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 254 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7370  short-chain alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 		 247 aa  101  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 		 266 aa  101  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 		 257 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.08 
 
 		 266 aa  95.9  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.68 
 
 		 246 aa  94.4  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  29.37 
 
 		 286 aa  94.7  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 		 258 aa  94.7  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 262 aa  94.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 		 284 aa  94  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 		 261 aa  93.6  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1474  short chain dehydrogenase  30.82 
 
 		 262 aa  93.6  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0346872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 		 262 aa  94  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.43 
 
 		 285 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.39 
 
 		 247 aa  92.8  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  26.37 
 
 		 265 aa  93.2  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 		 262 aa  91.3  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 255 aa  91.3  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.255887  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 		 259 aa  91.3  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 		 255 aa  91.3  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.485877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 		 246 aa  90.9  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 257 aa  90.9  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 		 290 aa  90.9  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 		 260 aa  90.1  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.3 
 
 		 259 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303734  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05340  d-arabinitol 2-dehydrogenase, putative  28.91 
 
 		 355 aa  89.4  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.656485  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1283  short-chain type dehydrogenase/reductase  26.46 
 
 		 277 aa  89.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 		 257 aa  89.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.46 
 
 		 253 aa  89  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  27.97 
 
 		 286 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 		 256 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>