More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4827 on replicon NC_009672
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  49.85 
 
 		 688 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  48.09 
 
 		 705 aa  660    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  46.95 
 
 		 705 aa  653    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  49.57 
 
 		 701 aa  649    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  47.8 
 
 		 705 aa  640    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  47.38 
 
 		 705 aa  652    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  49.85 
 
 		 688 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  48.16 
 
 		 706 aa  657    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  50.36 
 
 		 682 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 684 aa  1386    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  47.66 
 
 		 705 aa  654    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  47.38 
 
 		 705 aa  656    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  49.5 
 
 		 705 aa  674    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  50.14 
 
 		 715 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 		 657 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 		 657 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 		 653 aa  419  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  46.26 
 
 		 413 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  46.03 
 
 		 413 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 		 694 aa  353  4e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  37.41 
 
 		 700 aa  347  4e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  35.66 
 
 		 691 aa  345  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  31.59 
 
 		 689 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  33.23 
 
 		 680 aa  340  4e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 		 701 aa  336  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  34.16 
 
 		 707 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  36.17 
 
 		 664 aa  334  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  35.39 
 
 		 698 aa  332  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  33.29 
 
 		 698 aa  326  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  33.1 
 
 		 690 aa  325  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 		 698 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 		 699 aa  319  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  33.28 
 
 		 703 aa  315  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 		 706 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 		 701 aa  315  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 		 698 aa  313  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 		 707 aa  313  6.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 		 571 aa  311  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 713 aa  312  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 696 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 		 695 aa  308  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 		 678 aa  302  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 		 691 aa  294  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  34.76 
 
 		 687 aa  291  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 		 700 aa  291  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 		 702 aa  291  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 		 707 aa  287  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  33.97 
 
 		 677 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  34.26 
 
 		 677 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  34.26 
 
 		 677 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  34.03 
 
 		 700 aa  280  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 		 680 aa  280  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 		 676 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 		 689 aa  278  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 		 683 aa  277  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  33.57 
 
 		 679 aa  276  8e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  33.53 
 
 		 680 aa  274  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  34.09 
 
 		 652 aa  274  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 		 685 aa  272  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  33.38 
 
 		 684 aa  267  5e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  30.1 
 
 		 730 aa  261  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 		 677 aa  261  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 		 677 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  29.23 
 
 		 726 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  29.52 
 
 		 729 aa  250  8e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  29.25 
 
 		 730 aa  243  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  29.33 
 
 		 729 aa  238  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  30.7 
 
 		 705 aa  227  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 259 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 246 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 		 249 aa  107  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 249 aa  105  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  35.9 
 
 		 255 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 254 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 261 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.369643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 261 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 261 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.870324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 		 254 aa  99.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.425319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.2 
 
 		 267 aa  100  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 249 aa  100  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 249 aa  99  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 249 aa  99.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  30.2 
 
 		 259 aa  99.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 		 275 aa  99  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.03 
 
 		 247 aa  98.6  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4255  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  39.78 
 
 		 255 aa  98.2  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.337254  normal  0.605714 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 262 aa  97.4  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 		 256 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 		 254 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  31.54 
 
 		 253 aa  95.9  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 249 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 		 249 aa  95.9  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02396  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.62 
 
 		 261 aa  95.5  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 247 aa  95.5  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2139  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 		 254 aa  95.1  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  33.66 
 
 		 253 aa  94.4  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 		 249 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 249 aa  94.4  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  30.08 
 
 		 265 aa  94.4  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 		 253 aa  94  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>