81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3743 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 571 aa  1182    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  49.91 
 
 		 653 aa  528  1e-148  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  44.09 
 
 		 657 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  44.09 
 
 		 657 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 664 aa  342  8e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  33.23 
 
 		 684 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  37.82 
 
 		 715 aa  289  9e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 		 682 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 		 652 aa  263  8.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 688 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  33.08 
 
 		 688 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  36.45 
 
 		 413 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  36.89 
 
 		 413 aa  247  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  31.51 
 
 		 705 aa  242  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  30.39 
 
 		 705 aa  236  6e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  30.52 
 
 		 705 aa  233  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 		 705 aa  231  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  30.61 
 
 		 706 aa  229  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  30.44 
 
 		 701 aa  227  4e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  29.75 
 
 		 705 aa  224  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  29.25 
 
 		 689 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 705 aa  223  9e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  30.84 
 
 		 705 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  29.26 
 
 		 694 aa  217  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 		 691 aa  210  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  29.4 
 
 		 700 aa  206  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  32.09 
 
 		 690 aa  203  8e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  30.71 
 
 		 698 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  29.08 
 
 		 680 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  28.39 
 
 		 701 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 		 698 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.49 
 
 		 695 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  28.19 
 
 		 705 aa  194  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  27.51 
 
 		 701 aa  194  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  30 
 
 		 703 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  28.54 
 
 		 698 aa  190  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  28.69 
 
 		 726 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  28.14 
 
 		 702 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  28.54 
 
 		 699 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  27.97 
 
 		 698 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  28.8 
 
 		 683 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  27.52 
 
 		 706 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  28.24 
 
 		 696 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  27.87 
 
 		 730 aa  181  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  27.68 
 
 		 707 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  28.27 
 
 		 700 aa  178  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  29.64 
 
 		 707 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  28.75 
 
 		 729 aa  177  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  27.87 
 
 		 729 aa  173  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  27.36 
 
 		 689 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  28.48 
 
 		 730 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  27.03 
 
 		 707 aa  170  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  25.99 
 
 		 687 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  26.99 
 
 		 713 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  28.51 
 
 		 676 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  27.01 
 
 		 677 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  27.01 
 
 		 677 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  27.01 
 
 		 677 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  30.32 
 
 		 700 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  28.82 
 
 		 677 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  28 
 
 		 677 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  27.43 
 
 		 684 aa  154  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  26.05 
 
 		 691 aa  150  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  25.15 
 
 		 678 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  25.22 
 
 		 680 aa  143  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  26.64 
 
 		 685 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  27.65 
 
 		 680 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  24.2 
 
 		 679 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1395  class II aldolase/adducin-like  30.05 
 
 		 320 aa  67  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3221  hypothetical protein  26.62 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2155  class II aldolase/adducin family protein  31.25 
 
 		 351 aa  62.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0989166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4067  class II aldolase/adducin family protein  29.51 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2749  class II aldolase/adducin family protein  29.95 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2186  hypothetical protein  28.04 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2032  class II aldolase/adducin family protein  29.59 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.635701  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1997  class II aldolase/adducin family protein  26.17 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0696  class II aldolase/adducin family protein  26.73 
 
 		 349 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14011  hypothetical protein  24.73 
 
 		 334 aa  53.9  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3319  class II aldolase/adducin family protein  26.37 
 
 		 253 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  29.73 
 
 		 441 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2575  hypothetical protein  29.28 
 
 		 330 aa  47.4  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>