More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2454 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 694 aa  1416    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  66.42 
 
 		 700 aa  881    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  55.14 
 
 		 680 aa  748    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  55.75 
 
 		 691 aa  739    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  55.24 
 
 		 696 aa  690    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  57.69 
 
 		 695 aa  720    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  55.73 
 
 		 689 aa  803    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  70.57 
 
 		 701 aa  997    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  46.68 
 
 		 703 aa  611  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  45.23 
 
 		 698 aa  588  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  44.64 
 
 		 699 aa  588  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 		 698 aa  578  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  45.38 
 
 		 698 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  44.79 
 
 		 700 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  42.49 
 
 		 701 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  46.02 
 
 		 707 aa  545  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  45.71 
 
 		 700 aa  535  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 		 707 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  41.64 
 
 		 707 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  44.81 
 
 		 702 aa  510  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  41.38 
 
 		 713 aa  508  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  42.94 
 
 		 680 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  41.58 
 
 		 683 aa  497  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  40.75 
 
 		 706 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  44.05 
 
 		 705 aa  491  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 		 677 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 		 677 aa  489  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 		 677 aa  489  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  41.59 
 
 		 685 aa  484  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  42.4 
 
 		 677 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  41.53 
 
 		 691 aa  484  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  43.38 
 
 		 676 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  42.73 
 
 		 679 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  41.7 
 
 		 687 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.31 
 
 		 689 aa  475  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.38 
 
 		 678 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.73 
 
 		 684 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 		 680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 		 677 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  38.95 
 
 		 726 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 		 730 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  38.08 
 
 		 730 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  38.61 
 
 		 729 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  38.26 
 
 		 729 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 		 657 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 		 657 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 		 653 aa  363  4e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 705 aa  361  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 		 698 aa  362  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 		 684 aa  359  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  33.24 
 
 		 705 aa  348  2e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  34.75 
 
 		 705 aa  347  3e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 705 aa  345  1e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 		 706 aa  342  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  33.84 
 
 		 705 aa  342  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 705 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 		 688 aa  337  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  34.32 
 
 		 688 aa  335  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  32.97 
 
 		 701 aa  331  3e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  33.29 
 
 		 705 aa  331  3e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 		 664 aa  328  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 		 682 aa  326  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 		 690 aa  324  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 715 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  32.58 
 
 		 652 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  29.26 
 
 		 571 aa  216  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 		 413 aa  213  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 		 413 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 257 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  37.69 
 
 		 259 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.55 
 
 		 257 aa  148  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.45 
 
 		 260 aa  147  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.84 
 
 		 260 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5564  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.45 
 
 		 260 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  34.48 
 
 		 265 aa  140  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.52 
 
 		 260 aa  140  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4270  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.22 
 
 		 261 aa  138  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149446  normal  0.650814 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4380  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.22 
 
 		 261 aa  138  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209201  normal  0.21753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 258 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02396  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.84 
 
 		 261 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4528  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 258 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 276 aa  133  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2264  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.36 
 
 		 260 aa  133  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 		 251 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2411  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.68 
 
 		 260 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.520745  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 259 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.534322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2236  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.98 
 
 		 260 aa  132  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1592  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.45 
 
 		 266 aa  131  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 		 265 aa  130  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 		 254 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 		 255 aa  130  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6202  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.07 
 
 		 260 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.554491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 		 255 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 269 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.84 
 
 		 265 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 250 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1393  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.22 
 
 		 265 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0890604  hitchhiker  0.00200504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  32.43 
 
 		 255 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0676  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  31.52 
 
 		 262 aa  127  6e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.584191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  31.88 
 
 		 260 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>