More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4397 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 657 aa  1360    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 657 aa  1360    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  51.58 
 
 		 664 aa  676    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  52.42 
 
 		 653 aa  676    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  46 
 
 		 652 aa  570  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 		 684 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  37.19 
 
 		 688 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  37.34 
 
 		 688 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  43.89 
 
 		 571 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  35.4 
 
 		 705 aa  388  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  36.38 
 
 		 682 aa  385  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  34.23 
 
 		 705 aa  385  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  34.42 
 
 		 705 aa  383  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 		 715 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  33.52 
 
 		 705 aa  376  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  31.97 
 
 		 705 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  33.71 
 
 		 705 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 		 706 aa  371  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  34.49 
 
 		 690 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 		 689 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  34.35 
 
 		 705 aa  361  2e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 		 694 aa  362  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  35.01 
 
 		 698 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 		 680 aa  352  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 		 701 aa  348  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 701 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 		 695 aa  329  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 		 696 aa  323  6e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  31.21 
 
 		 699 aa  320  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 		 700 aa  319  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 		 701 aa  319  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 		 691 aa  317  5e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  30.75 
 
 		 713 aa  314  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  30.56 
 
 		 707 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  30.69 
 
 		 703 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  31.36 
 
 		 698 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  29.23 
 
 		 707 aa  297  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  30.69 
 
 		 700 aa  291  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  30.69 
 
 		 698 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  28.94 
 
 		 706 aa  291  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  38.57 
 
 		 413 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  38.33 
 
 		 413 aa  290  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  31.34 
 
 		 698 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  32.74 
 
 		 707 aa  283  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  29.73 
 
 		 729 aa  283  6.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  32.51 
 
 		 700 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  29.34 
 
 		 726 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  31.08 
 
 		 678 aa  282  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  30.34 
 
 		 683 aa  279  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  29.76 
 
 		 687 aa  279  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  29.08 
 
 		 730 aa  276  8e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  29.04 
 
 		 730 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  31.11 
 
 		 680 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  31.64 
 
 		 705 aa  273  9e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  29.85 
 
 		 677 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  29.73 
 
 		 689 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  31.49 
 
 		 677 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  30.13 
 
 		 677 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  30.13 
 
 		 677 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 702 aa  266  5.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.94 
 
 		 677 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.36 
 
 		 684 aa  262  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  30.01 
 
 		 676 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  29.76 
 
 		 691 aa  256  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  28.72 
 
 		 679 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  29.17 
 
 		 685 aa  254  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  29.17 
 
 		 680 aa  254  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  27.39 
 
 		 729 aa  252  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  32.03 
 
 		 259 aa  120  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 282 aa  115  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22780  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  32.43 
 
 		 251 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 		 268 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 270 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 248 aa  114  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  29.73 
 
 		 265 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 251 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  32.83 
 
 		 268 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 		 262 aa  112  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.675718  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 257 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 		 248 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 253 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 253 aa  111  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5536  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 		 262 aa  111  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0696  glucose 1-dehydrogenase  32.68 
 
 		 252 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 		 253 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 252 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.890933  normal  0.0516654 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 		 252 aa  110  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000391653  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 258 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549001  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 		 269 aa  108  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 		 256 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 		 257 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9206  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  35.43 
 
 		 246 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 		 261 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 		 247 aa  109  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 		 254 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.44826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3759  oxidoreductase  34.23 
 
 		 257 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.108381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 		 253 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2468  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 254 aa  108  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0400  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.08 
 
 		 247 aa  108  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0215607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 		 262 aa  108  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>