More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2003 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  73.9 
 
 		 701 aa  1026    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  69.65 
 
 		 705 aa  979    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  74.75 
 
 		 705 aa  1085    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  73.33 
 
 		 705 aa  1055    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  49.5 
 
 		 684 aa  662    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  72.77 
 
 		 705 aa  1052    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 705 aa  1443    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  66.52 
 
 		 705 aa  947    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  66.95 
 
 		 705 aa  967    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  73.23 
 
 		 706 aa  1056    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  44.57 
 
 		 688 aa  561  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  44.57 
 
 		 688 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  42.94 
 
 		 682 aa  538  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  40.55 
 
 		 715 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  33.71 
 
 		 657 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  33.71 
 
 		 657 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  31.74 
 
 		 689 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 		 680 aa  332  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  31.31 
 
 		 653 aa  328  3e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  33.83 
 
 		 694 aa  326  9e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  31.67 
 
 		 699 aa  323  8e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 		 691 aa  319  9e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 		 664 aa  317  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 		 701 aa  315  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 		 696 aa  313  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  32.53 
 
 		 713 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 		 701 aa  306  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  33.52 
 
 		 700 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  33.95 
 
 		 698 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  30.96 
 
 		 707 aa  302  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  30.03 
 
 		 698 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 		 695 aa  300  8e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  29.87 
 
 		 703 aa  298  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 		 707 aa  298  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 		 706 aa  297  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 		 676 aa  295  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 		 690 aa  294  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  30.59 
 
 		 700 aa  293  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.37 
 
 		 678 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  33.15 
 
 		 707 aa  286  8e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 		 698 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  30.85 
 
 		 677 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  31.37 
 
 		 683 aa  284  5.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  31.36 
 
 		 691 aa  282  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  31.13 
 
 		 677 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  31.13 
 
 		 677 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 		 726 aa  280  9e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  32.28 
 
 		 702 aa  276  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 		 685 aa  275  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.82 
 
 		 689 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  31.66 
 
 		 679 aa  274  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  29.11 
 
 		 698 aa  273  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 		 680 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 		 413 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  36.83 
 
 		 413 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 		 652 aa  266  7e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  30.94 
 
 		 680 aa  266  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  30.79 
 
 		 687 aa  265  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  31.85 
 
 		 677 aa  264  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  28.95 
 
 		 729 aa  264  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  28.67 
 
 		 730 aa  259  8e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  28.59 
 
 		 729 aa  259  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  30.74 
 
 		 700 aa  256  8e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  29.89 
 
 		 677 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  27.94 
 
 		 730 aa  249  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  31.15 
 
 		 705 aa  243  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  28.85 
 
 		 684 aa  239  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 571 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 249 aa  112  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 254 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 270 aa  104  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 249 aa  103  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  30 
 
 		 259 aa  101  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 249 aa  100  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 		 254 aa  100  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 254 aa  100  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.425319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 		 258 aa  98.2  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 269 aa  98.2  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 249 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  33.58 
 
 		 253 aa  96.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 		 249 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 		 260 aa  96.3  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.05 
 
 		 266 aa  95.5  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 		 263 aa  95.5  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 		 250 aa  94.7  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 		 254 aa  94.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 		 249 aa  94.4  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 		 252 aa  94.4  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 		 252 aa  94.4  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 254 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 		 267 aa  93.6  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  30.53 
 
 		 257 aa  92.8  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 		 253 aa  92.8  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 		 254 aa  92.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.41 
 
 		 246 aa  93.2  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.82 
 
 		 260 aa  92.8  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0494  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.25 
 
 		 260 aa  92  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5536  short chain dehydrogenase  31.64 
 
 		 262 aa  92  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 		 263 aa  92.4  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.393265  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 		 265 aa  92.4  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>