More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0494 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0494  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  100 
 
 
260 aa  531  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  71.76 
 
 
260 aa  374  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  69.88 
 
 
260 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2264  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  67.57 
 
 
260 aa  368  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2236  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  67.18 
 
 
260 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2411  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  64.73 
 
 
260 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.520745  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1428  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.28 
 
 
266 aa  338  4e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.818194  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.95 
 
 
260 aa  338  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5564  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  64.73 
 
 
260 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1592  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  62.5 
 
 
266 aa  336  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5312  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.6 
 
 
261 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4982  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.22 
 
 
261 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4380  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.22 
 
 
261 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209201  normal  0.21753 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6202  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.71 
 
 
260 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.554491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  58.53 
 
 
259 aa  333  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.791092  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4270  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.22 
 
 
261 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149446  normal  0.650814 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5713  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  62.84 
 
 
261 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110704  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0019  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  64.75 
 
 
261 aa  332  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5146  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  62.84 
 
 
261 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3125  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  62.84 
 
 
261 aa  332  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4526  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  62.84 
 
 
261 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.129874  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1065  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.46 
 
 
262 aa  332  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3167  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  62.84 
 
 
261 aa  332  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1704  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  62.5 
 
 
265 aa  332  5e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0021  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  64.37 
 
 
261 aa  331  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0021  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.98 
 
 
261 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0017  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.98 
 
 
261 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1524  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.98 
 
 
261 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0023  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.98 
 
 
261 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.39587  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2212  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.46 
 
 
262 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2236  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.46 
 
 
262 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1167  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.98 
 
 
261 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5865  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.46 
 
 
262 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1447  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.98 
 
 
261 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2038  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  64.23 
 
 
262 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2129  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.08 
 
 
262 aa  329  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213864  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5540  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.08 
 
 
262 aa  329  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2250  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  62.69 
 
 
262 aa  328  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1918  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.85 
 
 
262 aa  328  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0602  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.85 
 
 
262 aa  328  6e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.602337  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0505  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.85 
 
 
262 aa  328  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0876  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.85 
 
 
267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.462803  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02396  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  62.45 
 
 
261 aa  326  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0018  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.46 
 
 
262 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0918  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.46 
 
 
262 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.11344  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61.78 
 
 
265 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1961  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61.63 
 
 
265 aa  322  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.616628  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1393  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61 
 
 
265 aa  321  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0890604  hitchhiker  0.00200504 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1324  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.13 
 
 
260 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.83 
 
 
258 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.25 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.13 
 
 
261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2696  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.9 
 
 
260 aa  195  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.55 
 
 
258 aa  190  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.56 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
253 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1887  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.41 
 
 
260 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0166984  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.62 
 
 
252 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.45 
 
 
258 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.22 
 
 
261 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.22 
 
 
261 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00926  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.53 
 
 
252 aa  186  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.22 
 
 
261 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3432  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.296547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1388  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.4 
 
 
262 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.34 
 
 
261 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.22 
 
 
265 aa  178  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.67 
 
 
258 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.28 
 
 
261 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2860  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.28 
 
 
258 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.04 
 
 
252 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734906  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3482  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.06 
 
 
261 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.059744  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.23 
 
 
277 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  39.08 
 
 
265 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3554  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.17 
 
 
262 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.4 
 
 
261 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1408  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.68 
 
 
281 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3770  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.45 
 
 
252 aa  174  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2755  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.98 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137616  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1817  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.7 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181531  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448544  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2140  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.7 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4687  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.85 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3151  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.07 
 
 
260 aa  172  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10310  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.78 
 
 
263 aa  172  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.998138  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4002  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.29 
 
 
262 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2498  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.07 
 
 
260 aa  172  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.06 
 
 
260 aa  171  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0826  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.55 
 
 
266 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.162966  hitchhiker  0.000570032 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0932  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.52 
 
 
260 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733087  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1342  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.19 
 
 
257 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3917  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.68 
 
 
260 aa  169  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.283072  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  36.15 
 
 
259 aa  169  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
258 aa  169  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0412678  normal  0.59225 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.89 
 
 
261 aa  168  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1586  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.84 
 
 
261 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0571917  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.53 
 
 
262 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2311  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.35 
 
 
261 aa  165  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146201  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>