More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0694 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  68.09 
 
 		 730 aa  992    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  67.68 
 
 		 729 aa  996    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  63.01 
 
 		 729 aa  908    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 726 aa  1476    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  67.82 
 
 		 730 aa  990    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  44.48 
 
 		 703 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  42.82 
 
 		 707 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  43.54 
 
 		 698 aa  571  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  44.03 
 
 		 699 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  43.27 
 
 		 701 aa  561  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  43.6 
 
 		 698 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  42.92 
 
 		 698 aa  554  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  43.07 
 
 		 700 aa  543  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  42.06 
 
 		 713 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 		 707 aa  534  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  42.05 
 
 		 706 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  45.69 
 
 		 676 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  44.01 
 
 		 677 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  43.87 
 
 		 677 aa  525  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  43.87 
 
 		 677 aa  525  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  43.64 
 
 		 689 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  43.34 
 
 		 683 aa  513  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  43.28 
 
 		 678 aa  511  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  43.93 
 
 		 680 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  44.05 
 
 		 685 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  43.34 
 
 		 680 aa  502  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  44.09 
 
 		 702 aa  505  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  43.64 
 
 		 679 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  42.92 
 
 		 677 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  43.06 
 
 		 691 aa  498  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  41.77 
 
 		 700 aa  495  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  40.9 
 
 		 680 aa  481  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  43.24 
 
 		 687 aa  481  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 		 677 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  43.12 
 
 		 684 aa  477  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 		 707 aa  473  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  41.45 
 
 		 705 aa  459  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  36.05 
 
 		 689 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  38.95 
 
 		 694 aa  448  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  37.18 
 
 		 701 aa  415  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  36.7 
 
 		 691 aa  411  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  38.41 
 
 		 696 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  38.2 
 
 		 700 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  37.74 
 
 		 695 aa  361  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  31.93 
 
 		 705 aa  303  8.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  30.95 
 
 		 705 aa  298  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  31.56 
 
 		 705 aa  297  4e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  30.2 
 
 		 705 aa  280  9e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  29.7 
 
 		 701 aa  273  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  28.95 
 
 		 653 aa  272  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  29.67 
 
 		 705 aa  270  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 		 705 aa  269  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  29.34 
 
 		 657 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  29.34 
 
 		 657 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  30.81 
 
 		 690 aa  268  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  29.71 
 
 		 706 aa  263  6.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  29.05 
 
 		 705 aa  261  4e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  30.42 
 
 		 682 aa  257  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  30.26 
 
 		 688 aa  248  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  30.27 
 
 		 664 aa  247  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  30.26 
 
 		 688 aa  246  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  29.23 
 
 		 684 aa  244  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  28.65 
 
 		 698 aa  231  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  29.97 
 
 		 715 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  28.94 
 
 		 652 aa  207  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  28.69 
 
 		 571 aa  190  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  28.25 
 
 		 413 aa  164  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  28.47 
 
 		 413 aa  163  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 261 aa  103  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 		 268 aa  95.1  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 		 266 aa  92.8  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 		 268 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.41 
 
 		 266 aa  91.3  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 262 aa  90.5  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1474  short chain dehydrogenase  37 
 
 		 262 aa  90.5  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0346872  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 		 246 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  28.42 
 
 		 265 aa  89.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2207  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.43 
 
 		 247 aa  88.6  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.856829 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 		 262 aa  88.6  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 		 246 aa  87.4  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.39 
 
 		 256 aa  87.4  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 		 259 aa  87.4  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  28.32 
 
 		 259 aa  86.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4412  2,3-dihydroxy-2,3-dihydrophenylpropionate dehydrogenase  34.27 
 
 		 276 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  29.68 
 
 		 286 aa  86.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0520  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.88 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  28.82 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.44 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 		 251 aa  84  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 		 262 aa  84  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000627  putative sorbitol-6-phosphate 2-dehydrogenase  30.2 
 
 		 253 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0621  2,3-dihydroxy-2,3-dihydrophenylpropionate dehydrogenase  30.77 
 
 		 301 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1685  2,3-dihydroxy-2,3-dihydrophenylpropionate dehydrogenase  30.77 
 
 		 301 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1714  2,3-dihydroxy-2,3-dihydrophenylpropionate dehydrogenase  30.77 
 
 		 301 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.18 
 
 		 254 aa  82.8  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.743418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0544  2,3-dihydroxy-2,3-dihydrophenylpropionate dehydrogenase  30.77 
 
 		 301 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1658  2,3-dihydroxy-2,3-dihydrophenylpropionate dehydrogenase  30.77 
 
 		 301 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>