More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1724 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  62.43 
 
 		 698 aa  842    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  60.58 
 
 		 699 aa  829    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  50.5 
 
 		 713 aa  672    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  50.29 
 
 		 707 aa  691    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 705 aa  1438    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  62.17 
 
 		 700 aa  832    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  50.79 
 
 		 706 aa  668    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  62.57 
 
 		 700 aa  773    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  61.42 
 
 		 698 aa  843    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  51.65 
 
 		 707 aa  692    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  53.44 
 
 		 701 aa  718    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  59.65 
 
 		 702 aa  753    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  59.55 
 
 		 707 aa  764    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  61.56 
 
 		 703 aa  845    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  61.56 
 
 		 698 aa  832    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  47.72 
 
 		 677 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  43.39 
 
 		 689 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  47.2 
 
 		 677 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  47.2 
 
 		 677 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  48.09 
 
 		 680 aa  567  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  45.71 
 
 		 689 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  45.63 
 
 		 680 aa  565  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  45.79 
 
 		 730 aa  560  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  45.94 
 
 		 683 aa  559  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  47.87 
 
 		 685 aa  560  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  47.65 
 
 		 676 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  46.9 
 
 		 680 aa  554  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  47.49 
 
 		 677 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  46.71 
 
 		 687 aa  551  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  44.48 
 
 		 729 aa  543  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  47 
 
 		 677 aa  544  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  46.2 
 
 		 684 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  45.29 
 
 		 678 aa  541  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  44.8 
 
 		 729 aa  541  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  45.53 
 
 		 691 aa  538  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  45.94 
 
 		 679 aa  536  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  44.66 
 
 		 730 aa  534  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  43.74 
 
 		 701 aa  528  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  44.76 
 
 		 696 aa  525  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  43.76 
 
 		 694 aa  525  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.45 
 
 		 726 aa  509  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  44.57 
 
 		 691 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  44.56 
 
 		 700 aa  501  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  44.12 
 
 		 695 aa  467  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  31.64 
 
 		 657 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  31.64 
 
 		 657 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  32.41 
 
 		 653 aa  303  8.000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  31.15 
 
 		 705 aa  292  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  30.38 
 
 		 705 aa  290  9e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  31.99 
 
 		 701 aa  289  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  32.12 
 
 		 690 aa  288  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 		 688 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  32.22 
 
 		 688 aa  280  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  31.16 
 
 		 705 aa  278  4e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  31.87 
 
 		 698 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  30.75 
 
 		 705 aa  273  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  30.08 
 
 		 705 aa  271  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  30.89 
 
 		 705 aa  270  8.999999999999999e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  28.73 
 
 		 705 aa  261  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  32.42 
 
 		 664 aa  257  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  30.93 
 
 		 706 aa  256  9e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  31.65 
 
 		 684 aa  251  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 		 682 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  32.22 
 
 		 652 aa  244  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  29.52 
 
 		 715 aa  216  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  28.19 
 
 		 571 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  32.71 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  32.24 
 
 		 413 aa  187  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.09 
 
 		 266 aa  145  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 		 257 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 261 aa  140  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  34.09 
 
 		 259 aa  139  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 265 aa  134  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 		 277 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 		 295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 257 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 254 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1368  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 263 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.694726 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 		 262 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 		 261 aa  129  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 		 275 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 		 261 aa  127  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 252 aa  127  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 254 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.72 
 
 		 251 aa  125  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 		 262 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 		 276 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 		 270 aa  124  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 262 aa  124  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 262 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 262 aa  123  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3121  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 		 267 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 		 254 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 		 255 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 		 267 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 256 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 		 256 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 		 256 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 		 256 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 		 258 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>