More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3884 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  51.59 
 
 		 687 aa  667    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  51.01 
 
 		 698 aa  708    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  52.47 
 
 		 679 aa  683    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  51.08 
 
 		 699 aa  736    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  51.88 
 
 		 700 aa  676    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  49.06 
 
 		 684 aa  639    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  50.15 
 
 		 677 aa  648    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  79.6 
 
 		 707 aa  1181    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  50.44 
 
 		 680 aa  657    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  50.43 
 
 		 698 aa  717    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  73.93 
 
 		 701 aa  1060    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  50.87 
 
 		 698 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 706 aa  1449    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  50.79 
 
 		 705 aa  636    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  50.85 
 
 		 700 aa  725    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  50.59 
 
 		 676 aa  670    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  52.12 
 
 		 677 aa  689    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  51.24 
 
 		 689 aa  686    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  51.98 
 
 		 677 aa  684    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  51.92 
 
 		 685 aa  662    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  50.73 
 
 		 680 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  49.42 
 
 		 678 aa  655    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  77.26 
 
 		 713 aa  1133    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  51.32 
 
 		 677 aa  655    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  51.98 
 
 		 677 aa  684    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  68.87 
 
 		 707 aa  1023    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  51.73 
 
 		 707 aa  665    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  51.02 
 
 		 683 aa  684    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  50.79 
 
 		 703 aa  714    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  50.72 
 
 		 702 aa  649    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  50.07 
 
 		 691 aa  667    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 		 730 aa  585  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  43.72 
 
 		 729 aa  587  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  42.39 
 
 		 730 aa  581  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  42.08 
 
 		 729 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  42.05 
 
 		 726 aa  551  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  41.4 
 
 		 689 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 		 680 aa  497  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  40.75 
 
 		 694 aa  488  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  40.06 
 
 		 700 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  37.85 
 
 		 701 aa  460  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  39.49 
 
 		 691 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  39.46 
 
 		 696 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.83 
 
 		 695 aa  453  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 705 aa  340  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  32.25 
 
 		 705 aa  336  1e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  32.74 
 
 		 706 aa  333  4e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 		 690 aa  333  5e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  33.93 
 
 		 701 aa  331  3e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 		 684 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 		 705 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 		 705 aa  313  5.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 		 705 aa  311  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  31.2 
 
 		 705 aa  310  8e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  31.36 
 
 		 705 aa  309  9e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 688 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  31.5 
 
 		 653 aa  303  8.000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 		 688 aa  303  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  28.94 
 
 		 657 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  28.94 
 
 		 657 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  30.25 
 
 		 682 aa  293  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  28.77 
 
 		 698 aa  273  7e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  30.59 
 
 		 664 aa  273  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  30.79 
 
 		 715 aa  261  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  27.85 
 
 		 652 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  29.23 
 
 		 413 aa  193  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  28.77 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  27.52 
 
 		 571 aa  188  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.29 
 
 		 266 aa  127  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.62 
 
 		 245 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 261 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.36 
 
 		 249 aa  124  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  30.94 
 
 		 265 aa  124  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 257 aa  124  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0734  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.79 
 
 		 252 aa  123  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.79 
 
 		 252 aa  123  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2279  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.79 
 
 		 252 aa  123  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3005  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.79 
 
 		 252 aa  123  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1076  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.79 
 
 		 252 aa  123  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1234  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 		 252 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  32.57 
 
 		 259 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1082  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.79 
 
 		 252 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.47 
 
 		 252 aa  120  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 254 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4369  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.47 
 
 		 246 aa  118  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 		 602 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 251 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 257 aa  118  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 254 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 257 aa  117  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.59 
 
 		 245 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 		 257 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 		 249 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 270 aa  115  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  31.3 
 
 		 259 aa  115  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 254 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 268 aa  114  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.83 
 
 		 264 aa  114  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.83 
 
 		 246 aa  114  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.83 
 
 		 264 aa  114  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>