More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0840 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
266 aa  544  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  46.07 
 
 
269 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.12 
 
 
268 aa  244  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.42 
 
 
270 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.82 
 
 
268 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6708  glucose 1-dehydrogenase  47.55 
 
 
277 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0307985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.92 
 
 
272 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  42.64 
 
 
261 aa  201  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  42.29 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  41.9 
 
 
261 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  41.5 
 
 
261 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  41.5 
 
 
261 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  41.5 
 
 
261 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0368  glucose-1-dehydrogenase  43.08 
 
 
261 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0342914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  41.5 
 
 
261 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  41.5 
 
 
261 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  41.11 
 
 
261 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  41.5 
 
 
261 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  41.11 
 
 
261 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1839  glucose 1-dehydrogenase  39.92 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0372378  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.499955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 
269 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 
272 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
285 aa  175  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
271 aa  172  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.0331692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
254 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
254 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
270 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  38.19 
 
 
266 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1661  glucose 1-dehydrogenase  35.36 
 
 
268 aa  161  8.000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218295  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2297  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.23 
 
 
266 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844738  decreased coverage  0.0000370278 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
255 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2492  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  40.77 
 
 
266 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
257 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
258 aa  158  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.14 
 
 
302 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.685606  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1840  glucose 1-dehydrogenase  38.52 
 
 
266 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.714483  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
259 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0443  glucose 1-dehydrogenase  38.67 
 
 
266 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.83 
 
 
250 aa  155  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
253 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
269 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  38.28 
 
 
261 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.24 
 
 
248 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
261 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 
266 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
255 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
262 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
249 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
250 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
251 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.55 
 
 
246 aa  149  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0948  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.83 
 
 
249 aa  149  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000118605  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
255 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
254 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.25 
 
 
246 aa  149  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
247 aa  149  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  37.11 
 
 
261 aa  148  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
261 aa  148  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0433  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.53 
 
 
244 aa  148  7e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00087459  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.85 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.15 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  36.84 
 
 
254 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.78 
 
 
243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19840  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  38.87 
 
 
297 aa  145  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
257 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  33.2 
 
 
254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
254 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
263 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
250 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  33.6 
 
 
254 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
246 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 
251 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  40.49 
 
 
261 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
247 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
260 aa  144  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
261 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
278 aa  143  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 
260 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
256 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0881608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
300 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
247 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
246 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
263 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
256 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  34.94 
 
 
252 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
246 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.05 
 
 
244 aa  143  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>