More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3454 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 730 aa  1493    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  90.11 
 
 		 729 aa  1343    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  71.11 
 
 		 729 aa  1026    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  68.09 
 
 		 726 aa  992    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  87.12 
 
 		 730 aa  1294    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  47.04 
 
 		 703 aa  625  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  45.5 
 
 		 698 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  43.77 
 
 		 707 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  45.91 
 
 		 698 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  46.72 
 
 		 699 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  45.87 
 
 		 698 aa  595  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  46.58 
 
 		 700 aa  593  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  43.05 
 
 		 701 aa  572  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  43.17 
 
 		 707 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  42.39 
 
 		 706 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  43.22 
 
 		 713 aa  555  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  46.63 
 
 		 702 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  43.65 
 
 		 700 aa  531  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  45.72 
 
 		 707 aa  524  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  43.38 
 
 		 677 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  43.38 
 
 		 677 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  43.38 
 
 		 677 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  43.06 
 
 		 678 aa  508  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  42.16 
 
 		 683 aa  502  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  42.98 
 
 		 691 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  43.4 
 
 		 676 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  42.76 
 
 		 679 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  42.72 
 
 		 685 aa  497  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 		 680 aa  496  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  42.23 
 
 		 680 aa  495  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  42.6 
 
 		 677 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  42.24 
 
 		 689 aa  494  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  43.4 
 
 		 687 aa  490  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  44.66 
 
 		 705 aa  485  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  40.98 
 
 		 680 aa  480  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 		 684 aa  482  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  43.12 
 
 		 677 aa  478  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 		 689 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 		 691 aa  436  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  38.08 
 
 		 694 aa  436  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  37.11 
 
 		 701 aa  427  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  38.81 
 
 		 696 aa  418  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 700 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 		 695 aa  362  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  29.97 
 
 		 705 aa  269  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  29.64 
 
 		 705 aa  265  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  29.04 
 
 		 657 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  29.24 
 
 		 706 aa  262  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  29.04 
 
 		 657 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  29.63 
 
 		 705 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  28.38 
 
 		 705 aa  261  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  29.08 
 
 		 705 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  29.87 
 
 		 688 aa  254  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  27.54 
 
 		 705 aa  253  6e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  29.73 
 
 		 688 aa  253  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  27.57 
 
 		 653 aa  252  2e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  27.94 
 
 		 705 aa  249  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  28.59 
 
 		 701 aa  245  3e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 		 664 aa  242  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  29.01 
 
 		 690 aa  240  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  29.03 
 
 		 682 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  27.75 
 
 		 698 aa  234  6e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  29.25 
 
 		 684 aa  233  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  29.12 
 
 		 715 aa  217  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  30.07 
 
 		 652 aa  197  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  27.87 
 
 		 571 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  28.44 
 
 		 413 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  28.67 
 
 		 413 aa  150  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 266 aa  101  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 257 aa  101  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 		 268 aa  98.6  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 		 257 aa  98.6  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 		 254 aa  94.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  28.01 
 
 		 286 aa  93.6  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 		 261 aa  92.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7370  short-chain alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 		 247 aa  91.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 		 261 aa  90.9  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 		 284 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2207  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.25 
 
 		 247 aa  89.7  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.856829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1474  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 		 262 aa  89  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0346872  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 		 267 aa  88.6  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.49838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.6 
 
 		 259 aa  87.8  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303734  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.66 
 
 		 258 aa  87.8  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.17 
 
 		 258 aa  87  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.68 
 
 		 262 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5825  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.25 
 
 		 298 aa  87  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.77 
 
 		 256 aa  87  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.76 
 
 		 256 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.1 
 
 		 250 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  26.03 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.45 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 		 267 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  29.86 
 
 		 247 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 		 290 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4754  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.42 
 
 		 276 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2925  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  24.73 
 
 		 296 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.72 
 
 		 246 aa  82.8  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>