More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0410 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  76.88 
 
 		 705 aa  1117    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  74.75 
 
 		 705 aa  1087    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 701 aa  1430    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  69.65 
 
 		 705 aa  991    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  49.57 
 
 		 684 aa  648    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  73.97 
 
 		 706 aa  1064    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  74.33 
 
 		 705 aa  1087    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  73.9 
 
 		 705 aa  1059    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  69.59 
 
 		 705 aa  1013    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  68.51 
 
 		 705 aa  983    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  43.44 
 
 		 688 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  43.44 
 
 		 688 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  43.72 
 
 		 682 aa  542  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  41.37 
 
 		 715 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  32.37 
 
 		 689 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 657 aa  350  5e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 657 aa  350  5e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  32.19 
 
 		 653 aa  343  5.999999999999999e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 698 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 699 aa  333  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 680 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  33.93 
 
 		 706 aa  325  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  32.97 
 
 		 694 aa  324  3e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  32.72 
 
 		 707 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 		 701 aa  323  9.000000000000001e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 		 698 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 		 707 aa  320  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 713 aa  317  4e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  33.66 
 
 		 664 aa  317  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 		 691 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  32.23 
 
 		 698 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 		 703 aa  310  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.97 
 
 		 701 aa  307  4.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 		 696 aa  302  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  35.82 
 
 		 695 aa  300  6e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  31.11 
 
 		 700 aa  298  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 		 698 aa  298  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  33.62 
 
 		 700 aa  290  8e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  34.23 
 
 		 702 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  32.13 
 
 		 700 aa  280  4e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  29.69 
 
 		 726 aa  280  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  30.56 
 
 		 690 aa  279  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 		 683 aa  276  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 707 aa  275  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 		 678 aa  275  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 		 689 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  31.64 
 
 		 685 aa  271  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  32.86 
 
 		 687 aa  268  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  31.54 
 
 		 677 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  32.43 
 
 		 679 aa  268  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  31.39 
 
 		 691 aa  267  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  28.76 
 
 		 729 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  31.97 
 
 		 677 aa  265  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  31.97 
 
 		 677 aa  265  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  29.08 
 
 		 730 aa  264  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 		 680 aa  262  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  37.33 
 
 		 413 aa  260  6e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 		 652 aa  260  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  31.36 
 
 		 680 aa  259  9e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 		 676 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  37.11 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  28.22 
 
 		 729 aa  253  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  28.45 
 
 		 730 aa  252  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  31.29 
 
 		 677 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  31.11 
 
 		 677 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  32.15 
 
 		 705 aa  244  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  31.59 
 
 		 684 aa  241  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 		 571 aa  239  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 249 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 		 263 aa  106  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 		 263 aa  105  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.288132 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.39 
 
 		 263 aa  104  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.393265  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 254 aa  104  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.425319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 		 254 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  33.08 
 
 		 253 aa  102  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 254 aa  101  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 		 249 aa  101  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 269 aa  100  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 		 247 aa  100  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 249 aa  99  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.81 
 
 		 266 aa  97.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 		 253 aa  96.7  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  29.2 
 
 		 255 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 248 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 275 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 		 262 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 		 252 aa  95.9  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 291 aa  95.5  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60014  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05340  d-arabinitol 2-dehydrogenase, putative  30.38 
 
 		 355 aa  95.1  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.656485  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 260 aa  94.7  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 		 258 aa  95.1  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.79 
 
 		 259 aa  94.7  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.791092  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.65 
 
 		 252 aa  94.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 		 271 aa  94.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 		 282 aa  94.4  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 266 aa  94  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 		 249 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 		 266 aa  93.6  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.471953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 		 256 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 		 256 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>