More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0088 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  100 
 
 
259 aa  528  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.791092  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2264  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  62.69 
 
 
260 aa  348  4e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2236  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  62.31 
 
 
260 aa  347  1e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1592  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  62.02 
 
 
266 aa  342  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1428  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  62.02 
 
 
266 aa  342  4e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.818194  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.23 
 
 
260 aa  337  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0494  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  58.53 
 
 
260 aa  333  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.23 
 
 
260 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1704  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61.24 
 
 
265 aa  328  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.23 
 
 
260 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_003296  RS02396  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.08 
 
 
261 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5564  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.62 
 
 
260 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1065  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.69 
 
 
262 aa  317  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0017  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61 
 
 
261 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1524  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61 
 
 
261 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1918  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61 
 
 
262 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0021  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61 
 
 
261 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0023  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61 
 
 
261 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.39587  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1447  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61 
 
 
261 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1167  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61 
 
 
261 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0505  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61 
 
 
262 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0021  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61 
 
 
261 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0602  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61 
 
 
262 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.602337  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4380  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  58.91 
 
 
261 aa  316  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209201  normal  0.21753 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0876  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61 
 
 
267 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.462803  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4270  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  58.91 
 
 
261 aa  316  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149446  normal  0.650814 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2236  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.47 
 
 
262 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0019  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61 
 
 
261 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2038  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61 
 
 
262 aa  316  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5865  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.47 
 
 
262 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2212  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.47 
 
 
262 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3125  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.85 
 
 
261 aa  315  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6202  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.38 
 
 
260 aa  315  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.554491 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4526  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.85 
 
 
261 aa  315  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.129874  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5146  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.85 
 
 
261 aa  315  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5312  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.46 
 
 
261 aa  315  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5713  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.85 
 
 
261 aa  315  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110704  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2411  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  58.08 
 
 
260 aa  315  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.520745  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0018  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.62 
 
 
262 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0918  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.62 
 
 
262 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.11344  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2129  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.08 
 
 
262 aa  314  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213864  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2250  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.69 
 
 
262 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4982  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.46 
 
 
261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3167  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.46 
 
 
261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5540  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.69 
 
 
262 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1393  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  58.3 
 
 
265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0890604  hitchhiker  0.00200504 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1961  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  57.75 
 
 
265 aa  308  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.616628  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  57.53 
 
 
265 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1324  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.36 
 
 
260 aa  210  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.1 
 
 
258 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
253 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.19 
 
 
252 aa  188  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.41 
 
 
252 aa  185  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734906  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.31 
 
 
261 aa  185  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1807  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.73 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.43 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.3 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.8 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.28 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2696  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.23 
 
 
260 aa  181  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.58 
 
 
258 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.16 
 
 
261 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.16 
 
 
261 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3770  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.98 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.53 
 
 
261 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1797  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.14 
 
 
260 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10310  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.92 
 
 
263 aa  178  5.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.998138  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
258 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0412678  normal  0.59225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.45 
 
 
262 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3482  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.93 
 
 
261 aa  174  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.059744  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1887  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.89 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0166984  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.5 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3432  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.31 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.296547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.21 
 
 
261 aa  172  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.84 
 
 
261 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00926  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.22 
 
 
252 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.58 
 
 
258 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0081  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.19 
 
 
271 aa  168  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.243269  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
258 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.29 
 
 
265 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8513  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.58 
 
 
254 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2860  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.58 
 
 
258 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0047  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.58 
 
 
277 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7916  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.45 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4841  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.82 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1544  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  37.11 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0575047  normal  0.138596 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  35.61 
 
 
259 aa  161  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0932  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.58 
 
 
260 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733087  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.87 
 
 
261 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.37 
 
 
258 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.16 
 
 
277 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0366  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.98 
 
 
249 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
257 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.98 
 
 
262 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0938  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.15 
 
 
261 aa  159  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.37 
 
 
258 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.66 
 
 
261 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
248 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
248 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448544  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
248 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>