More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1615 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 254 aa  500  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.425319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.08 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 263 aa  169  6e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  40.98 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  40.98 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  40.98 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  36.03 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170009  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.8 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  35.63 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000174886  normal  0.399546 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 255 aa  161  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  41.63 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.67 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000245701  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  38.58 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  41.63 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 276 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0981  2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase, putative  38.17 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0918  putative 2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase  38.17 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.311873  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.6 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  40.4 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  38.84 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.48 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1151  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.24 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.256582 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 249 aa  154  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 		 516 aa  155  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  38.67 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  39.06 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  39.37 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  39.37 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  39.37 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  36.69 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.03 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0919  putative oxidoreductase  39.76 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 263 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  41.46 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  41.46 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  41.46 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  41.2 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.89 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  39.45 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  39.53 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 255 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.89 
 
 		 246 aa  152  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 255 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 258 aa  151  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 		 263 aa  151  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.78 
 
 		 246 aa  151  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 		 275 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11380  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.98 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.833794 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 255 aa  151  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 254 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245481  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.39 
 
 		 264 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.39 
 
 		 264 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.39 
 
 		 264 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  38.13 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  37.4 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.37 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0118  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.55 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101866  normal  0.0165193 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 252 aa  148  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 249 aa  148  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2422  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 271 aa  148  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  35.6 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>