More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2469 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
249 aa  501  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.71 
 
 
248 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.59 
 
 
247 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.18 
 
 
247 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.59 
 
 
247 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.08 
 
 
282 aa  348  5e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.07 
 
 
268 aa  335  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.73 
 
 
254 aa  334  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.71 
 
 
256 aa  315  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7095  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.55 
 
 
252 aa  277  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.37 
 
 
234 aa  271  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.283479  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.23 
 
 
248 aa  269  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.03 
 
 
247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.03 
 
 
247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.42 
 
 
260 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11168  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.92 
 
 
233 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.67 
 
 
233 aa  238  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
233 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
233 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
233 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.18 
 
 
251 aa  221  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.62 
 
 
234 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.77 
 
 
257 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.84 
 
 
247 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.68 
 
 
188 aa  215  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0721  2-hydroxycyclohexanecarboxyl-CoA dehydrogenase  44.18 
 
 
255 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.3 
 
 
255 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.02 
 
 
255 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.16 
 
 
255 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
241 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 
253 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1850  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  39.15 
 
 
255 aa  176  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00172962  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1185  2-hydroxycyclohexanecarboxyl-CoA dehydrogenase  44.44 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.938573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.16 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.000297813  normal  0.0786529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
257 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
247 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
263 aa  170  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
257 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.81 
 
 
255 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0435  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.32 
 
 
238 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
253 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.46 
 
 
247 aa  168  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000457862  decreased coverage  0.00144514 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
249 aa  168  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
248 aa  168  9e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
250 aa  168  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
248 aa  167  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3935  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.22 
 
 
249 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
245 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00853251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.8 
 
 
246 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
255 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017919 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
254 aa  164  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
260 aa  164  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.49 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.34 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.11 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3954  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0540156  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.11 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  38.19 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000512545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2001  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
245 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.03 
 
 
245 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2308  putative 3-oxoacyl-ACP reductase  40.89 
 
 
252 aa  163  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
251 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000195486  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04660  2-hydroxycyclohexane-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  40.32 
 
 
261 aa  162  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.84 
 
 
246 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.1 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.84 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.84 
 
 
246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1608  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.71 
 
 
244 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000263068  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  40.16 
 
 
240 aa  162  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1120  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 
249 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 
280 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
270 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
254 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0694225  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.06 
 
 
249 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2407  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.93 
 
 
246 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
253 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0429944  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1628  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.65 
 
 
247 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.87 
 
 
240 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7331  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.37 
 
 
249 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
249 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.77933  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
253 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.145372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.2 
 
 
246 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1914  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.2 
 
 
246 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.225982  unclonable  0.00000025173 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3264  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.44 
 
 
246 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
254 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3106  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.11 
 
 
246 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000229278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.44 
 
 
246 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.44 
 
 
246 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
259 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
240 aa  158  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
254 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1505  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.65 
 
 
244 aa  158  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0160485  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>