More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2085 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 		 245 aa  506  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  84.02 
 
 		 245 aa  435  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  81.63 
 
 		 245 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  82.04 
 
 		 245 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  82.45 
 
 		 245 aa  424  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  81.56 
 
 		 245 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  80 
 
 		 245 aa  417  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  81.07 
 
 		 244 aa  418  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  77.55 
 
 		 245 aa  408  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  76.33 
 
 		 245 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  75.92 
 
 		 245 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  76.42 
 
 		 246 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  76.42 
 
 		 246 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  76.42 
 
 		 248 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  76.42 
 
 		 246 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  76.42 
 
 		 246 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  76.42 
 
 		 246 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  76.42 
 
 		 246 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  76.83 
 
 		 246 aa  391  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  75.61 
 
 		 246 aa  387  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  77.64 
 
 		 246 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  76.42 
 
 		 260 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  77.24 
 
 		 246 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  77.24 
 
 		 246 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  77.24 
 
 		 246 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  77.24 
 
 		 246 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  76.83 
 
 		 246 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  76.83 
 
 		 246 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  75.61 
 
 		 246 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  72.36 
 
 		 246 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  72.36 
 
 		 246 aa  367  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  72.36 
 
 		 246 aa  367  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  71.95 
 
 		 246 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  71.95 
 
 		 246 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  71.54 
 
 		 246 aa  362  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1633  acetyacetyl-CoA reductase  71.14 
 
 		 246 aa  358  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.389319 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  63.37 
 
 		 247 aa  323  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3362  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.1 
 
 		 246 aa  299  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02411  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.1 
 
 		 246 aa  298  6e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  59.59 
 
 		 246 aa  295  5e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0283  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.51 
 
 		 246 aa  292  4e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0254  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.51 
 
 		 246 aa  292  4e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  55.28 
 
 		 247 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.51 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  56.79 
 
 		 246 aa  268  7e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1610  acetoacetyl-CoA reductase  59.18 
 
 		 247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710856 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  55.97 
 
 		 248 aa  265  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  55.97 
 
 		 246 aa  264  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  54.51 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  55.74 
 
 		 248 aa  258  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  52.87 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  53.66 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  52.46 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  52.46 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  52.46 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  52.46 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  53.66 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  53.66 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  52.46 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  53.66 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  53.66 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  52.87 
 
 		 251 aa  255  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0557  acetoacetyl-CoA reductase  55.06 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.306822  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.69 
 
 		 248 aa  254  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  53.69 
 
 		 248 aa  254  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  52.46 
 
 		 248 aa  254  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  53.25 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.25 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  53.31 
 
 		 248 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.03 
 
 		 247 aa  252  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  51.02 
 
 		 248 aa  252  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  52.87 
 
 		 249 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 		 248 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 		 248 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  50.2 
 
 		 248 aa  248  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  52.05 
 
 		 248 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  51.64 
 
 		 248 aa  247  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.8 
 
 		 203 aa  247  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1198  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.88 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  53.28 
 
 		 249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  49.79 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  53.47 
 
 		 246 aa  242  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  50.21 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  53.19 
 
 		 236 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.77 
 
 		 236 aa  241  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  52.67 
 
 		 241 aa  241  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  52.44 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1519  acetoacetyl-CoA reductase  51.63 
 
 		 247 aa  238  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.004615  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  52.26 
 
 		 241 aa  238  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3107  acetoacetyl-CoA reductase  53.11 
 
 		 240 aa  238  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  53.47 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0603  hypothetical protein  52.42 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0620  hypothetical protein  52.82 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3029  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.24 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3821  acetoacetyl-CoA reductase  52.92 
 
 		 241 aa  235  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2322  hypothetical protein  51 
 
 		 247 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  50 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1056  hypothetical protein  50.6 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>