More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02411 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02411  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 
246 aa  503  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0254  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  86.94 
 
 
246 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0283  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  86.94 
 
 
246 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3362  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  85.77 
 
 
246 aa  444  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155625  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1633  acetyacetyl-CoA reductase  67.48 
 
 
246 aa  370  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.389319 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  67.89 
 
 
246 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  66.67 
 
 
246 aa  367  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  66.67 
 
 
246 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  66.67 
 
 
246 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  64.23 
 
 
246 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  64.23 
 
 
246 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  64.63 
 
 
246 aa  353  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  63.82 
 
 
246 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  63.82 
 
 
248 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  63.82 
 
 
246 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  63.82 
 
 
246 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  63.41 
 
 
260 aa  352  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  63.82 
 
 
246 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  63.82 
 
 
246 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  63.82 
 
 
246 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  63.82 
 
 
246 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  63.41 
 
 
246 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  63.41 
 
 
246 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  63.01 
 
 
246 aa  350  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  62.6 
 
 
246 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  62.6 
 
 
246 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  62.6 
 
 
246 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  61.79 
 
 
246 aa  346  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  63.01 
 
 
246 aa  344  8e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  60.16 
 
 
245 aa  323  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.54 
 
 
245 aa  321  6e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  59.35 
 
 
245 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  59.35 
 
 
245 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  59.67 
 
 
244 aa  319  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.72 
 
 
245 aa  315  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.72 
 
 
245 aa  316  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  59.35 
 
 
245 aa  315  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.37 
 
 
245 aa  311  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.37 
 
 
245 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.1 
 
 
245 aa  298  6e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  54.13 
 
 
247 aa  289  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  53.47 
 
 
246 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  53.5 
 
 
246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.85 
 
 
246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  50.81 
 
 
247 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  50.81 
 
 
247 aa  255  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 
264 aa  251  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 
264 aa  251  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  48.78 
 
 
277 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 
247 aa  249  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1610  acetoacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
247 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.710856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  48.78 
 
 
247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  46.91 
 
 
248 aa  240  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  48.94 
 
 
236 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  46.53 
 
 
248 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  46.34 
 
 
247 aa  237  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  48.97 
 
 
248 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  48.15 
 
 
248 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  45.45 
 
 
249 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  48.56 
 
 
248 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0557  acetoacetyl-CoA reductase  46.96 
 
 
248 aa  235  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.306822  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  47.66 
 
 
236 aa  234  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  48.15 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  47.76 
 
 
248 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  47.76 
 
 
248 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  45.87 
 
 
248 aa  232  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  45.49 
 
 
248 aa  232  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  45.45 
 
 
248 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  43.85 
 
 
248 aa  222  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  46.75 
 
 
246 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.37 
 
 
203 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  44.26 
 
 
248 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  45.87 
 
 
241 aa  218  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  43.21 
 
 
248 aa  217  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1198  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  44.9 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  45.12 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1519  acetoacetyl-CoA reductase  45.12 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.004615  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  44.26 
 
 
248 aa  211  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  44.63 
 
 
249 aa  211  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3212  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.8 
 
 
240 aa  209  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.41 
 
 
247 aa  208  8e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  42.4 
 
 
248 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  41.39 
 
 
240 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  40.96 
 
 
252 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  42.98 
 
 
242 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  42.98 
 
 
242 aa  204  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  42.39 
 
 
241 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  42.8 
 
 
241 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  42.56 
 
 
242 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  42.56 
 
 
240 aa  202  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2384  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.82 
 
 
241 aa  202  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.503632 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0603  hypothetical protein  44.16 
 
 
246 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>