More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0917 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  93.22 
 
 		 246 aa  330  9e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  78.89 
 
 		 246 aa  283  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  77.78 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  77.78 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  77.78 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  77.78 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  77.78 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  77.78 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  77.78 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  77.78 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  77.78 
 
 		 260 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  78.33 
 
 		 246 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  78.33 
 
 		 246 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  78.33 
 
 		 246 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  77.78 
 
 		 246 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  77.78 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  77.22 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  78.33 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  77.22 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  76.67 
 
 		 246 aa  279  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  76.67 
 
 		 246 aa  278  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  77.22 
 
 		 246 aa  278  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1633  acetyacetyl-CoA reductase  76.67 
 
 		 246 aa  276  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.389319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  76.84 
 
 		 246 aa  275  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  75.14 
 
 		 246 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  76.84 
 
 		 245 aa  271  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  76.84 
 
 		 245 aa  271  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  72.88 
 
 		 245 aa  262  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  73.3 
 
 		 245 aa  262  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  72.32 
 
 		 245 aa  259  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.19 
 
 		 245 aa  259  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  72.32 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.75 
 
 		 245 aa  256  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.75 
 
 		 245 aa  256  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  70.45 
 
 		 245 aa  255  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  67.8 
 
 		 245 aa  246  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  61.93 
 
 		 247 aa  235  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  57.22 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  60.34 
 
 		 247 aa  222  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02411  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.37 
 
 		 246 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3362  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.93 
 
 		 246 aa  218  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  57.71 
 
 		 249 aa  216  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  60.8 
 
 		 246 aa  214  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  58.29 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0254  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.11 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  59.44 
 
 		 246 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0283  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.11 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  59.09 
 
 		 248 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  59.09 
 
 		 248 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  59.09 
 
 		 248 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  59.09 
 
 		 248 aa  211  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  60.92 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  59.09 
 
 		 248 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  59.09 
 
 		 248 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0557  acetoacetyl-CoA reductase  56 
 
 		 248 aa  209  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.306822  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  57.8 
 
 		 248 aa  209  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  56.57 
 
 		 248 aa  208  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  56.57 
 
 		 248 aa  207  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  57.95 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  56.57 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  58.33 
 
 		 252 aa  202  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  58.86 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  55.74 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2322  hypothetical protein  54.29 
 
 		 247 aa  200  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1056  hypothetical protein  54.76 
 
 		 247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.43 
 
 		 277 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0603  hypothetical protein  56.07 
 
 		 246 aa  198  5e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  55.11 
 
 		 248 aa  197  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  55.93 
 
 		 236 aa  197  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0620  hypothetical protein  55.49 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  55.37 
 
 		 264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  55.37 
 
 		 264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  54.86 
 
 		 247 aa  195  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1519  acetoacetyl-CoA reductase  53.76 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.004615  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  53.45 
 
 		 246 aa  195  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  52.27 
 
 		 246 aa  195  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2384  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  54.82 
 
 		 241 aa  194  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.503632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0505  acetoacetyl-CoA reductase  57.63 
 
 		 241 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3029  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.41 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  54.8 
 
 		 247 aa  193  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  54.8 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3107  acetoacetyl-CoA reductase  53.55 
 
 		 240 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  52.02 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  54.86 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  52.3 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.67 
 
 		 236 aa  191  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  52.3 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  54.24 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2305  hypothetical protein  53.18 
 
 		 246 aa  191  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  52.84 
 
 		 247 aa  191  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  52.46 
 
 		 242 aa  191  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  56.65 
 
 		 248 aa  191  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2027  acetoacetyl-CoA reductase  57.23 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4345  acetoacetyl CoA reductase; poly-beta-hydroxybutyrate biosynthesis  56.5 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2467  acetoacetyl-CoA reductase  57.71 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  56.25 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  50.86 
 
 		 240 aa  189  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  52.27 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  51.91 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>