More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1609 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  100 
 
 
246 aa  508  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  88.21 
 
 
246 aa  458  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  72.43 
 
 
251 aa  370  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  70.49 
 
 
264 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  70.49 
 
 
264 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  69.96 
 
 
247 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  69.96 
 
 
247 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  68.44 
 
 
247 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  67.62 
 
 
247 aa  358  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  67.08 
 
 
277 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  69.07 
 
 
236 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  69.49 
 
 
236 aa  355  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  67.9 
 
 
247 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  65.43 
 
 
247 aa  349  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  62.55 
 
 
248 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  61.32 
 
 
248 aa  327  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  60.91 
 
 
248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  60.91 
 
 
248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  60.08 
 
 
248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  60.91 
 
 
248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  60.91 
 
 
248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  60.91 
 
 
248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  61.32 
 
 
248 aa  324  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  61.32 
 
 
248 aa  324  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  61.32 
 
 
248 aa  322  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  60.08 
 
 
248 aa  315  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  60.66 
 
 
249 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  59.67 
 
 
248 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  59.67 
 
 
246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  60.08 
 
 
246 aa  305  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  59.02 
 
 
248 aa  305  6e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  60.49 
 
 
246 aa  301  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  60.49 
 
 
246 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1633  acetyacetyl-CoA reductase  59.67 
 
 
246 aa  300  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.389319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1198  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  60.25 
 
 
249 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  60.08 
 
 
246 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  57.2 
 
 
248 aa  299  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  60.08 
 
 
246 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  60.08 
 
 
246 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  58.44 
 
 
248 aa  299  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  60.08 
 
 
246 aa  299  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  56.79 
 
 
248 aa  298  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  58.85 
 
 
248 aa  298  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  59.67 
 
 
246 aa  298  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  58.85 
 
 
246 aa  297  8e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  58.85 
 
 
246 aa  297  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  58.85 
 
 
246 aa  297  8e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  58.85 
 
 
246 aa  297  8e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  58.85 
 
 
246 aa  297  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  58.85 
 
 
246 aa  297  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  60.08 
 
 
246 aa  297  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  60.08 
 
 
246 aa  297  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  58.44 
 
 
260 aa  297  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  59.67 
 
 
246 aa  296  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  58.2 
 
 
246 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  56.56 
 
 
248 aa  295  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  56.79 
 
 
248 aa  295  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  59.26 
 
 
246 aa  295  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  58.44 
 
 
246 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  60 
 
 
249 aa  292  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  60.08 
 
 
245 aa  292  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  59.02 
 
 
245 aa  287  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.44 
 
 
246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.2 
 
 
245 aa  281  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.61 
 
 
245 aa  280  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  58.61 
 
 
246 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.61 
 
 
245 aa  279  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.79 
 
 
245 aa  277  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  57.14 
 
 
241 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0505  acetoacetyl-CoA reductase  57.14 
 
 
241 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.92 
 
 
244 aa  276  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  55.56 
 
 
247 aa  275  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3689  acetoacetyl-CoA reductase  56.15 
 
 
241 aa  275  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  57.14 
 
 
241 aa  275  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.38 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.79 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.97 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0508  acetoacetyl-CoA reductase  56.73 
 
 
241 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0305  acetoacetyl-CoA reductase  55.92 
 
 
241 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108778  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0557  acetoacetyl-CoA reductase  56.73 
 
 
248 aa  270  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.306822  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3061  acetoacetyl-CoA reductase  54.69 
 
 
241 aa  268  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109458  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  56.97 
 
 
246 aa  268  5.9999999999999995e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.79 
 
 
245 aa  268  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3362  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.44 
 
 
246 aa  268  8e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155625  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  53.47 
 
 
241 aa  267  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3107  acetoacetyl-CoA reductase  54.69 
 
 
240 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02411  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.85 
 
 
246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2753  acetoacetyl-CoA reductase  53.66 
 
 
240 aa  265  7e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  50.81 
 
 
240 aa  262  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  55.92 
 
 
241 aa  262  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  53.88 
 
 
241 aa  262  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.22 
 
 
240 aa  261  6.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2467  acetoacetyl-CoA reductase  53.88 
 
 
241 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.1 
 
 
247 aa  259  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  55.33 
 
 
246 aa  260  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0283  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.21 
 
 
246 aa  259  3e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0254  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.21 
 
 
246 aa  259  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4149  acetoacetyl-CoA reductase  53.09 
 
 
241 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.738636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3821  acetoacetyl-CoA reductase  52.26 
 
 
241 aa  258  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4345  acetoacetyl CoA reductase; poly-beta-hydroxybutyrate biosynthesis  53.88 
 
 
241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>