More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0305 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0305  acetoacetyl-CoA reductase  100 
 
 		 241 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108778  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0508  acetoacetyl-CoA reductase  95.85 
 
 		 241 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  91.67 
 
 		 241 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3689  acetoacetyl-CoA reductase  87.39 
 
 		 241 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3061  acetoacetyl-CoA reductase  85.83 
 
 		 241 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109458  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0505  acetoacetyl-CoA reductase  87.5 
 
 		 241 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  87.5 
 
 		 241 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  80.25 
 
 		 241 aa  394  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  79.58 
 
 		 241 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  76.35 
 
 		 241 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3107  acetoacetyl-CoA reductase  73.44 
 
 		 240 aa  361  7.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4345  acetoacetyl CoA reductase; poly-beta-hydroxybutyrate biosynthesis  73.53 
 
 		 241 aa  359  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2027  acetoacetyl-CoA reductase  72.27 
 
 		 241 aa  355  5e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2467  acetoacetyl-CoA reductase  70.95 
 
 		 241 aa  354  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4149  acetoacetyl-CoA reductase  72.27 
 
 		 241 aa  352  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.738636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  74.15 
 
 		 242 aa  350  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  73.31 
 
 		 242 aa  350  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  73.31 
 
 		 242 aa  350  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2402  acetoacetyl-CoA reductase  71.85 
 
 		 240 aa  348  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0747  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  71.85 
 
 		 240 aa  348  3e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3821  acetoacetyl-CoA reductase  70.17 
 
 		 241 aa  347  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5119  acetoacetyl-CoA reductase  69.92 
 
 		 242 aa  335  5e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28454  normal  0.417051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3116  acetoacetyl-CoA reductase  73.53 
 
 		 241 aa  335  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.937548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  69.07 
 
 		 242 aa  333  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  68.64 
 
 		 242 aa  332  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  68.64 
 
 		 242 aa  331  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  68.33 
 
 		 240 aa  331  5e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3375  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  65 
 
 		 240 aa  321  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  66.25 
 
 		 240 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1946  acetoacetyl-CoA reductase  66.67 
 
 		 242 aa  318  7e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  65.97 
 
 		 242 aa  317  7.999999999999999e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0492  acetoacetyl-CoA reductase  63.45 
 
 		 240 aa  315  6e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3067  acetoacetyl-CoA reductase  64.29 
 
 		 240 aa  314  7e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  63.75 
 
 		 240 aa  314  7e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  65.83 
 
 		 241 aa  313  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1574  acetoacetyl-CoA reductase  63.03 
 
 		 241 aa  310  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50991  normal  0.311491 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3736  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  64.29 
 
 		 240 aa  310  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2753  acetoacetyl-CoA reductase  64.17 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3212  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  62.08 
 
 		 240 aa  305  6e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2384  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  63.49 
 
 		 241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.503632 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0354  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  60.83 
 
 		 240 aa  296  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  60.83 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  56.73 
 
 		 246 aa  275  7e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.92 
 
 		 246 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3065  acetoacetyl-CoA reductase  56.3 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000577101  normal  0.0493909 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  55.97 
 
 		 251 aa  264  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  54.1 
 
 		 248 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  54.51 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  54.1 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  54.1 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  54.1 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  54.1 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  54.51 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.26 
 
 		 277 aa  255  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 		 247 aa  254  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 		 247 aa  254  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  54.32 
 
 		 247 aa  254  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 		 264 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 		 264 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  50.62 
 
 		 247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  54.32 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 		 248 aa  248  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  48.97 
 
 		 248 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  50.21 
 
 		 247 aa  247  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.94 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  51.22 
 
 		 252 aa  242  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  50.64 
 
 		 236 aa  242  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  55.97 
 
 		 246 aa  241  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.44 
 
 		 247 aa  241  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  50.64 
 
 		 236 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  52.67 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  52.26 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  55.56 
 
 		 246 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  51.64 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.67 
 
 		 248 aa  237  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  50.41 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 		 246 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  48.56 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  48.56 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 		 246 aa  231  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 		 246 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  54.96 
 
 		 249 aa  231  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 		 248 aa  231  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.26 
 
 		 245 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000520  acetoacetyl-CoA reductase  52.03 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  49.59 
 
 		 248 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>