More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3470 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  100 
 
 
242 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  99.17 
 
 
242 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  98.35 
 
 
242 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5119  acetoacetyl-CoA reductase  97.11 
 
 
242 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28454  normal  0.417051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  83.68 
 
 
242 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  81.59 
 
 
242 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  81.59 
 
 
242 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  70.17 
 
 
241 aa  350  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3107  acetoacetyl-CoA reductase  71.61 
 
 
240 aa  345  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  70.71 
 
 
241 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  71.01 
 
 
241 aa  340  8e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0508  acetoacetyl-CoA reductase  70.34 
 
 
241 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3061  acetoacetyl-CoA reductase  69.33 
 
 
241 aa  333  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109458  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3689  acetoacetyl-CoA reductase  69.2 
 
 
241 aa  332  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0305  acetoacetyl-CoA reductase  68.64 
 
 
241 aa  332  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108778  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2402  acetoacetyl-CoA reductase  68.49 
 
 
240 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0747  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  68.49 
 
 
240 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  66.11 
 
 
241 aa  331  7.000000000000001e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  68.07 
 
 
241 aa  330  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1574  acetoacetyl-CoA reductase  67.09 
 
 
241 aa  328  6e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50991  normal  0.311491 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4345  acetoacetyl CoA reductase; poly-beta-hydroxybutyrate biosynthesis  66.95 
 
 
241 aa  324  7e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0505  acetoacetyl-CoA reductase  67.23 
 
 
241 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3821  acetoacetyl-CoA reductase  66.53 
 
 
241 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4149  acetoacetyl-CoA reductase  64.29 
 
 
241 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.738636 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2467  acetoacetyl-CoA reductase  65.97 
 
 
241 aa  315  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2027  acetoacetyl-CoA reductase  65.27 
 
 
241 aa  314  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  63.29 
 
 
240 aa  314  8e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  62.45 
 
 
240 aa  311  7.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  64.98 
 
 
241 aa  310  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3375  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  61.6 
 
 
240 aa  310  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1946  acetoacetyl-CoA reductase  63.98 
 
 
242 aa  309  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  61.83 
 
 
242 aa  307  8e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3736  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  62.61 
 
 
240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2384  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  65.55 
 
 
241 aa  306  3e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.503632 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3067  acetoacetyl-CoA reductase  62.61 
 
 
240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3116  acetoacetyl-CoA reductase  65.55 
 
 
241 aa  301  7.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.937548  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0492  acetoacetyl-CoA reductase  60.5 
 
 
240 aa  300  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  59.92 
 
 
240 aa  294  8e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3212  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  57.81 
 
 
240 aa  285  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  56.96 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0354  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  56.54 
 
 
240 aa  278  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679576  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  57.68 
 
 
246 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2753  acetoacetyl-CoA reductase  57.38 
 
 
240 aa  268  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  55.79 
 
 
248 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  57.02 
 
 
246 aa  261  6e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  53.28 
 
 
247 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  52.87 
 
 
247 aa  258  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  52.87 
 
 
247 aa  258  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
247 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  52.46 
 
 
264 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  52.46 
 
 
264 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  56.15 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  53.69 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  53.91 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  53.5 
 
 
246 aa  252  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
248 aa  252  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  53.11 
 
 
252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3065  acetoacetyl-CoA reductase  53.59 
 
 
247 aa  251  7e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000577101  normal  0.0493909 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  54.29 
 
 
246 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  53.5 
 
 
246 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  53.09 
 
 
246 aa  248  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  54.1 
 
 
248 aa  247  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  53.09 
 
 
246 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  52.24 
 
 
248 aa  247  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  53.09 
 
 
246 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  52.23 
 
 
248 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  52.67 
 
 
246 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  52.67 
 
 
246 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  52.67 
 
 
246 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  52.67 
 
 
246 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  52.67 
 
 
248 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  52.67 
 
 
246 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  53.09 
 
 
246 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  52.67 
 
 
246 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  52.24 
 
 
251 aa  245  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
248 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  53.09 
 
 
246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.46 
 
 
247 aa  244  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  51.01 
 
 
248 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.67 
 
 
246 aa  244  6.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  52.89 
 
 
246 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  52.36 
 
 
236 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
248 aa  244  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
248 aa  244  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
248 aa  244  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
248 aa  244  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.36 
 
 
236 aa  244  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.64 
 
 
277 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  52.26 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 
246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  50.59 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  52.26 
 
 
246 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  52.26 
 
 
246 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.65 
 
 
246 aa  241  6e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.65 
 
 
245 aa  241  9e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.5 
 
 
245 aa  240  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 
246 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 
246 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>