More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00406 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  100 
 
 
246 aa  504  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  83.74 
 
 
246 aa  414  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  63.11 
 
 
249 aa  299  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  57.44 
 
 
242 aa  278  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1519  acetoacetyl-CoA reductase  60.16 
 
 
247 aa  278  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.004615  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  55.74 
 
 
246 aa  278  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5119  acetoacetyl-CoA reductase  56.61 
 
 
242 aa  277  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28454  normal  0.417051 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.56 
 
 
240 aa  276  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  57.02 
 
 
242 aa  276  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  54.47 
 
 
252 aa  276  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  56.1 
 
 
247 aa  275  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  57.02 
 
 
242 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3107  acetoacetyl-CoA reductase  56.61 
 
 
240 aa  275  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.33 
 
 
246 aa  275  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  57.44 
 
 
241 aa  274  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  58.2 
 
 
241 aa  272  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  54.88 
 
 
264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  54.88 
 
 
264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  50.4 
 
 
248 aa  271  6e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  57.38 
 
 
241 aa  271  8.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  58.09 
 
 
242 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  54.88 
 
 
247 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.5 
 
 
248 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  53.25 
 
 
246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  53.25 
 
 
246 aa  268  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  52.44 
 
 
246 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  54.07 
 
 
247 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  51.63 
 
 
246 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  54.96 
 
 
240 aa  267  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  56.5 
 
 
242 aa  267  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  53.66 
 
 
247 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  53.66 
 
 
246 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  53.25 
 
 
246 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  53.25 
 
 
246 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  53.25 
 
 
246 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  53.25 
 
 
246 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  53.25 
 
 
246 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  53.25 
 
 
246 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  53.66 
 
 
246 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  54.07 
 
 
277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  53.25 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  52.85 
 
 
246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  56.91 
 
 
242 aa  265  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  53.25 
 
 
260 aa  265  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  56.91 
 
 
242 aa  265  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  54.73 
 
 
241 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  53.25 
 
 
246 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  55.56 
 
 
241 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3061  acetoacetyl-CoA reductase  56.38 
 
 
241 aa  265  7e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109458  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  52.44 
 
 
246 aa  264  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  53.25 
 
 
246 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  53.06 
 
 
246 aa  264  8.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  52.85 
 
 
246 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1633  acetyacetyl-CoA reductase  52.85 
 
 
246 aa  264  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.389319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.56 
 
 
240 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  52.85 
 
 
246 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  52.85 
 
 
246 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.25 
 
 
247 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  52.44 
 
 
246 aa  262  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  53.47 
 
 
248 aa  261  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  53.47 
 
 
248 aa  261  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0747  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.14 
 
 
240 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2402  acetoacetyl-CoA reductase  55.14 
 
 
240 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0505  acetoacetyl-CoA reductase  57.38 
 
 
241 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.47 
 
 
245 aa  260  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3689  acetoacetyl-CoA reductase  56.38 
 
 
241 aa  259  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2384  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  56.15 
 
 
241 aa  259  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.503632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  54.69 
 
 
247 aa  258  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
248 aa  258  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 
251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.65 
 
 
245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  52.03 
 
 
247 aa  257  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.84 
 
 
245 aa  257  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0305  acetoacetyl-CoA reductase  56.15 
 
 
241 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108778  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  53.91 
 
 
249 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4345  acetoacetyl CoA reductase; poly-beta-hydroxybutyrate biosynthesis  55.74 
 
 
241 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.43 
 
 
245 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.41 
 
 
246 aa  256  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  53.28 
 
 
248 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1946  acetoacetyl-CoA reductase  59.09 
 
 
242 aa  255  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 
248 aa  255  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  54.27 
 
 
236 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  54.27 
 
 
236 aa  255  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
241 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  52.03 
 
 
246 aa  255  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0557  acetoacetyl-CoA reductase  53.44 
 
 
248 aa  255  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.306822  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3029  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  54.69 
 
 
249 aa  255  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3375  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  54.32 
 
 
240 aa  255  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0508  acetoacetyl-CoA reductase  55.14 
 
 
241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3212  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.67 
 
 
240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  54.13 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.46 
 
 
245 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3067  acetoacetyl-CoA reductase  54.96 
 
 
240 aa  253  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3736  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  54.55 
 
 
240 aa  251  7e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3821  acetoacetyl-CoA reductase  54.51 
 
 
241 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.07 
 
 
244 aa  251  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  52.48 
 
 
247 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.64 
 
 
245 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4149  acetoacetyl-CoA reductase  54.1 
 
 
241 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.738636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>