More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3375 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3375  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  100 
 
 		 240 aa  491  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2402  acetoacetyl-CoA reductase  75.73 
 
 		 240 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0747  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  75.73 
 
 		 240 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2027  acetoacetyl-CoA reductase  74.17 
 
 		 241 aa  377  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2467  acetoacetyl-CoA reductase  73.33 
 
 		 241 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3821  acetoacetyl-CoA reductase  72.08 
 
 		 241 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4345  acetoacetyl CoA reductase; poly-beta-hydroxybutyrate biosynthesis  71.67 
 
 		 241 aa  364  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4149  acetoacetyl-CoA reductase  70.54 
 
 		 241 aa  362  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.738636 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0492  acetoacetyl-CoA reductase  70.71 
 
 		 240 aa  358  5e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3067  acetoacetyl-CoA reductase  70.71 
 
 		 240 aa  357  9e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3736  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  67.78 
 
 		 240 aa  347  8e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3116  acetoacetyl-CoA reductase  73.03 
 
 		 241 aa  346  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.937548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  67.22 
 
 		 241 aa  341  7e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3107  acetoacetyl-CoA reductase  67.36 
 
 		 240 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  66.67 
 
 		 241 aa  332  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3061  acetoacetyl-CoA reductase  67.22 
 
 		 241 aa  332  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109458  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3689  acetoacetyl-CoA reductase  65.98 
 
 		 241 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  65.83 
 
 		 241 aa  325  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  64.58 
 
 		 241 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  65.15 
 
 		 241 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0508  acetoacetyl-CoA reductase  65.83 
 
 		 241 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0305  acetoacetyl-CoA reductase  65 
 
 		 241 aa  321  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108778  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1574  acetoacetyl-CoA reductase  62.08 
 
 		 241 aa  317  7e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50991  normal  0.311491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  65.27 
 
 		 242 aa  317  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0505  acetoacetyl-CoA reductase  65.13 
 
 		 241 aa  314  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  61.18 
 
 		 242 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5119  acetoacetyl-CoA reductase  61.18 
 
 		 242 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28454  normal  0.417051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  61.6 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  60.76 
 
 		 242 aa  308  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  63.87 
 
 		 242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  63.87 
 
 		 242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  61.92 
 
 		 240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  61.51 
 
 		 240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2384  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  61.41 
 
 		 241 aa  298  6e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.503632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  59.92 
 
 		 242 aa  292  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  57.74 
 
 		 240 aa  285  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3212  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  58.16 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1946  acetoacetyl-CoA reductase  59.58 
 
 		 242 aa  281  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2753  acetoacetyl-CoA reductase  58.58 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  57.74 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  57.08 
 
 		 241 aa  278  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3065  acetoacetyl-CoA reductase  55.7 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000577101  normal  0.0493909 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0354  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.33 
 
 		 240 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  56.61 
 
 		 249 aa  251  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  54.32 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  55.14 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  50.83 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  48.98 
 
 		 246 aa  234  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 		 248 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  49.38 
 
 		 248 aa  230  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  48.77 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  49.38 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  46.94 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  47.95 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  49.18 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 		 249 aa  225  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  49.59 
 
 		 248 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3029  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  50 
 
 		 249 aa  224  8e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  46.5 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  49.18 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  49.18 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  49.18 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  49.18 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  49.59 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  46.5 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  46.5 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  46.91 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0631  acetoacetyl-CoA reductase  47.97 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  47.35 
 
 		 252 aa  221  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  46.28 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  46.09 
 
 		 251 aa  218  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  48.77 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  44.86 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  44.86 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  46.09 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  49.59 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  47.93 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  48.36 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  45.27 
 
 		 277 aa  214  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.67 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000520  acetoacetyl-CoA reductase  47.76 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2422  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.67 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  46.5 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  45.92 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  48.35 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05365  acetoacetyl-CoA reductase  46.53 
 
 		 268 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  45.68 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  47.93 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.69 
 
 		 247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  45.49 
 
 		 236 aa  211  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  46.5 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  46.28 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  45.68 
 
 		 248 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.89 
 
 		 245 aa  208  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0797  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.62 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.61 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1231  acetoacetyl-CoA reductase  49.79 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>