More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2782 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  100 
 
 
236 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  99.15 
 
 
264 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  99.15 
 
 
264 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  96.61 
 
 
236 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  94.07 
 
 
247 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  94.49 
 
 
247 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  93.22 
 
 
247 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  83.05 
 
 
247 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  79.66 
 
 
277 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  75 
 
 
247 aa  384  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  73.31 
 
 
247 aa  374  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  70.34 
 
 
246 aa  358  5e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  69.49 
 
 
246 aa  355  5e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  67.8 
 
 
251 aa  353  8.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  69.36 
 
 
248 aa  345  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  66.1 
 
 
248 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  66.1 
 
 
248 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  65.25 
 
 
248 aa  333  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  64.68 
 
 
248 aa  328  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  64.68 
 
 
248 aa  328  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  65.11 
 
 
248 aa  328  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  64.68 
 
 
248 aa  328  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  64.68 
 
 
248 aa  328  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  64.68 
 
 
248 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  62.98 
 
 
248 aa  323  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  63.83 
 
 
248 aa  322  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  66.1 
 
 
249 aa  321  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  62.55 
 
 
248 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  63.83 
 
 
248 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  61.7 
 
 
248 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  63.83 
 
 
248 aa  311  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  64.81 
 
 
248 aa  311  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  63.95 
 
 
248 aa  308  5e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  64.1 
 
 
248 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  60 
 
 
249 aa  288  7e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  58.72 
 
 
246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  58.3 
 
 
246 aa  281  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1198  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  59.31 
 
 
249 aa  281  8.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  57.45 
 
 
246 aa  277  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  57.45 
 
 
246 aa  277  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  57.45 
 
 
246 aa  277  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  57.45 
 
 
246 aa  277  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  57.45 
 
 
246 aa  277  8e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  57.45 
 
 
246 aa  277  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  57.45 
 
 
248 aa  277  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  57.02 
 
 
260 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1633  acetyacetyl-CoA reductase  58.3 
 
 
246 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.389319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  56.6 
 
 
246 aa  272  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  56.6 
 
 
246 aa  271  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  56.17 
 
 
246 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  56.17 
 
 
246 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  56.17 
 
 
246 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  56.17 
 
 
246 aa  268  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  56.6 
 
 
246 aa  267  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  55.74 
 
 
246 aa  266  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  56.6 
 
 
246 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  56.6 
 
 
246 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  55.74 
 
 
246 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.17 
 
 
245 aa  265  7e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0557  acetoacetyl-CoA reductase  57.58 
 
 
248 aa  264  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.306822  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  55.32 
 
 
246 aa  263  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.89 
 
 
244 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  54.04 
 
 
246 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.65 
 
 
241 aa  262  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.89 
 
 
245 aa  262  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.47 
 
 
245 aa  259  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.08 
 
 
245 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  53.22 
 
 
241 aa  258  6e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.47 
 
 
245 aa  257  8e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.04 
 
 
245 aa  257  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.24 
 
 
245 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  51.93 
 
 
241 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  53.65 
 
 
242 aa  255  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.13 
 
 
240 aa  255  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  53.85 
 
 
240 aa  255  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  52.79 
 
 
241 aa  254  7e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.48 
 
 
240 aa  254  9e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  54.59 
 
 
246 aa  252  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.42 
 
 
246 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  51.27 
 
 
247 aa  250  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  51.28 
 
 
242 aa  249  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  51.28 
 
 
242 aa  249  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.34 
 
 
245 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  54.15 
 
 
246 aa  249  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.91 
 
 
245 aa  248  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3061  acetoacetyl-CoA reductase  50.21 
 
 
241 aa  248  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109458  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  53.19 
 
 
246 aa  248  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  53.22 
 
 
242 aa  247  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  51.28 
 
 
240 aa  246  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  53.22 
 
 
242 aa  246  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3689  acetoacetyl-CoA reductase  49.57 
 
 
241 aa  246  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  51.07 
 
 
241 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0508  acetoacetyl-CoA reductase  51.5 
 
 
241 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  52.34 
 
 
241 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  52.36 
 
 
242 aa  244  8e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5119  acetoacetyl-CoA reductase  52.36 
 
 
242 aa  244  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28454  normal  0.417051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2467  acetoacetyl-CoA reductase  49.79 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.19 
 
 
245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  48.29 
 
 
242 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0305  acetoacetyl-CoA reductase  50.64 
 
 
241 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108778  normal  0.261711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>