More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2560 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 
245 aa  501  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  93.06 
 
 
245 aa  473  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  89.8 
 
 
245 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  90.2 
 
 
245 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  90.57 
 
 
245 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  91.36 
 
 
244 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  89.75 
 
 
245 aa  458  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  80 
 
 
245 aa  417  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  78.37 
 
 
245 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  80 
 
 
245 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  79.59 
 
 
245 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  76.42 
 
 
246 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  76.42 
 
 
248 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  76.42 
 
 
246 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  76.42 
 
 
246 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  76.42 
 
 
246 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  76.42 
 
 
246 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  76.42 
 
 
246 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  75.61 
 
 
246 aa  390  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  76.02 
 
 
260 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  76.83 
 
 
246 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  75.61 
 
 
246 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  75.61 
 
 
246 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  76.02 
 
 
246 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  76.02 
 
 
246 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  75.61 
 
 
246 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  76.02 
 
 
246 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  75.2 
 
 
246 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  75.2 
 
 
246 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  75.2 
 
 
246 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  75.61 
 
 
246 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  74.8 
 
 
246 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  75.2 
 
 
246 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  73.98 
 
 
246 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1633  acetyacetyl-CoA reductase  73.98 
 
 
246 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.389319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  71.54 
 
 
246 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  62.3 
 
 
247 aa  321  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  63.67 
 
 
246 aa  315  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02411  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  59.35 
 
 
246 aa  315  4e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0254  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.37 
 
 
246 aa  306  3e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3362  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.13 
 
 
246 aa  305  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155625  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0283  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.37 
 
 
246 aa  306  3e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  55.28 
 
 
247 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  57.61 
 
 
246 aa  279  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  57.2 
 
 
246 aa  276  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1610  acetoacetyl-CoA reductase  59.18 
 
 
247 aa  271  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.710856 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  53.06 
 
 
248 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  53.66 
 
 
247 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  51.63 
 
 
248 aa  270  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  53.06 
 
 
248 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 
248 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  53.06 
 
 
248 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  53.06 
 
 
248 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  53.06 
 
 
248 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  54.29 
 
 
248 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  53.66 
 
 
247 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
249 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  53.66 
 
 
247 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  53.66 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  53.66 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  53.06 
 
 
248 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 
248 aa  268  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  53.69 
 
 
251 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.85 
 
 
277 aa  262  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  53.69 
 
 
248 aa  262  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  50.2 
 
 
248 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0557  acetoacetyl-CoA reductase  55.02 
 
 
248 aa  261  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.306822  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.88 
 
 
203 aa  261  6.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 
248 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
248 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.63 
 
 
247 aa  258  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.62 
 
 
236 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  54.04 
 
 
236 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  53.5 
 
 
248 aa  256  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  51.22 
 
 
247 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.84 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.69 
 
 
248 aa  253  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  48.57 
 
 
248 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  48.57 
 
 
248 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  49.38 
 
 
248 aa  244  6.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  49.38 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1198  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  50.66 
 
 
249 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  53.53 
 
 
241 aa  241  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0631  acetoacetyl-CoA reductase  52.46 
 
 
246 aa  239  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  52.67 
 
 
242 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  53.06 
 
 
249 aa  238  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  52.67 
 
 
242 aa  237  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  52.26 
 
 
242 aa  236  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1056  hypothetical protein  49.19 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5119  acetoacetyl-CoA reductase  51.22 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28454  normal  0.417051 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2322  hypothetical protein  49.19 
 
 
247 aa  232  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  52.21 
 
 
246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05365  acetoacetyl-CoA reductase  50.4 
 
 
268 aa  231  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  47.72 
 
 
240 aa  231  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  50.81 
 
 
242 aa  230  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  50.62 
 
 
241 aa  230  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000520  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 
246 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  48.97 
 
 
241 aa  228  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>