More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4412 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  100 
 
 
248 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  100 
 
 
248 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  69.92 
 
 
277 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  67.21 
 
 
248 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  67.07 
 
 
247 aa  359  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  67.89 
 
 
247 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  66.26 
 
 
264 aa  355  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  66.26 
 
 
264 aa  355  5e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  65.85 
 
 
247 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  65.85 
 
 
247 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  64.11 
 
 
248 aa  343  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  66.53 
 
 
236 aa  341  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  66.1 
 
 
236 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  60.57 
 
 
247 aa  338  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  60.89 
 
 
248 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  62.96 
 
 
246 aa  335  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  61.69 
 
 
248 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  61.29 
 
 
248 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  61.29 
 
 
248 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  61.29 
 
 
248 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  61.29 
 
 
248 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  60.89 
 
 
248 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  61.38 
 
 
247 aa  332  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  62.9 
 
 
248 aa  332  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  61.54 
 
 
248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  61.29 
 
 
248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  60.89 
 
 
248 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  61.32 
 
 
246 aa  324  8.000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  61.13 
 
 
251 aa  322  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  57.72 
 
 
249 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  58.13 
 
 
248 aa  292  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  56.56 
 
 
248 aa  288  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  56.5 
 
 
248 aa  287  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  55.69 
 
 
248 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1198  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  59.35 
 
 
249 aa  284  7e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  51.61 
 
 
247 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  57.14 
 
 
249 aa  268  8e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  51.43 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  51.43 
 
 
246 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  51.43 
 
 
246 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  51.43 
 
 
246 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  51.43 
 
 
246 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  51.43 
 
 
246 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  51.43 
 
 
246 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  51.02 
 
 
260 aa  264  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 
246 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  51.02 
 
 
246 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  51.84 
 
 
246 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  51.02 
 
 
246 aa  261  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  51.02 
 
 
246 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  51.02 
 
 
246 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  51.43 
 
 
246 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  51.02 
 
 
246 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  49.8 
 
 
246 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  51.43 
 
 
246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
246 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
246 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
246 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.61 
 
 
245 aa  255  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.21 
 
 
244 aa  254  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.44 
 
 
241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 
241 aa  252  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  49.38 
 
 
241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1633  acetyacetyl-CoA reductase  50.2 
 
 
246 aa  251  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.389319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
246 aa  251  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
246 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.41 
 
 
245 aa  250  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.59 
 
 
246 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  50.62 
 
 
240 aa  249  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.61 
 
 
245 aa  249  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.59 
 
 
245 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50 
 
 
245 aa  248  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4345  acetoacetyl CoA reductase; poly-beta-hydroxybutyrate biosynthesis  49.58 
 
 
241 aa  248  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  49.38 
 
 
240 aa  247  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3061  acetoacetyl-CoA reductase  49.79 
 
 
241 aa  247  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109458  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.57 
 
 
245 aa  247  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.26 
 
 
248 aa  247  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.8 
 
 
245 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  50.62 
 
 
240 aa  246  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  48.97 
 
 
240 aa  245  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  53.47 
 
 
246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.37 
 
 
245 aa  245  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0557  acetoacetyl-CoA reductase  53.23 
 
 
248 aa  244  6.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.306822  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  48.56 
 
 
241 aa  244  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  48.99 
 
 
252 aa  243  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  49.18 
 
 
242 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0631  acetoacetyl-CoA reductase  47.97 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  49.18 
 
 
242 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  49.79 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.37 
 
 
245 aa  242  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  52.24 
 
 
246 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3689  acetoacetyl-CoA reductase  49.17 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.97 
 
 
245 aa  242  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  48.99 
 
 
242 aa  242  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  47.18 
 
 
248 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  48.56 
 
 
247 aa  240  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2467  acetoacetyl-CoA reductase  48.15 
 
 
241 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1519  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 
247 aa  239  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.004615  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  47.95 
 
 
242 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>