More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0557 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0557  acetoacetyl-CoA reductase  100 
 
 
248 aa  513  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.306822  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  58.23 
 
 
247 aa  298  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  57.55 
 
 
246 aa  298  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  57.09 
 
 
246 aa  298  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  57.09 
 
 
246 aa  298  8e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  56.68 
 
 
246 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  56.28 
 
 
248 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  57.49 
 
 
248 aa  296  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  56.5 
 
 
248 aa  295  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1633  acetyacetyl-CoA reductase  56.68 
 
 
246 aa  293  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.389319 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  57.83 
 
 
247 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  55.87 
 
 
246 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  55.87 
 
 
246 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.45 
 
 
245 aa  292  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  55.87 
 
 
246 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  55.87 
 
 
248 aa  292  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  55.87 
 
 
246 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  55.87 
 
 
246 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  55.87 
 
 
246 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  56.28 
 
 
246 aa  292  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  58.3 
 
 
251 aa  292  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  55.87 
 
 
260 aa  291  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  57.43 
 
 
247 aa  289  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  57.83 
 
 
264 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  57.83 
 
 
264 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  57.43 
 
 
277 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  56.73 
 
 
246 aa  288  8e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  57.43 
 
 
247 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  54.66 
 
 
246 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  56.63 
 
 
247 aa  285  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  55.06 
 
 
246 aa  285  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  55.06 
 
 
246 aa  285  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  54.66 
 
 
246 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  54.66 
 
 
246 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  54.66 
 
 
246 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.22 
 
 
245 aa  285  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  56.33 
 
 
248 aa  284  8e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  55.74 
 
 
249 aa  284  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  55.06 
 
 
246 aa  284  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  53.85 
 
 
246 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  53.44 
 
 
246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56 
 
 
245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.44 
 
 
245 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.44 
 
 
245 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  53.85 
 
 
246 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.87 
 
 
244 aa  281  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.07 
 
 
246 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.84 
 
 
245 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  52.63 
 
 
246 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.44 
 
 
245 aa  279  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.47 
 
 
248 aa  279  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.02 
 
 
245 aa  278  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  54.84 
 
 
247 aa  278  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  53.04 
 
 
246 aa  276  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  54.44 
 
 
248 aa  275  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.62 
 
 
245 aa  275  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  51.42 
 
 
247 aa  275  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  57.56 
 
 
236 aa  274  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  54.66 
 
 
248 aa  274  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  55.87 
 
 
249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  54.84 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  57.98 
 
 
236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  56.18 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  54.25 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  54.84 
 
 
248 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  54.84 
 
 
248 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  54.84 
 
 
248 aa  272  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  54.84 
 
 
248 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.06 
 
 
245 aa  271  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  54.44 
 
 
248 aa  271  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  54.03 
 
 
248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  54.84 
 
 
248 aa  268  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  53.44 
 
 
248 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  52.82 
 
 
252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  54.29 
 
 
248 aa  264  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  53.23 
 
 
248 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  53.23 
 
 
248 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  54.66 
 
 
246 aa  261  4.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1198  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  57.14 
 
 
249 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.42 
 
 
247 aa  257  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  53.44 
 
 
246 aa  255  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
242 aa  251  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  50.2 
 
 
242 aa  250  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1610  acetoacetyl-CoA reductase  51.21 
 
 
247 aa  250  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.710856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5119  acetoacetyl-CoA reductase  50.4 
 
 
242 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28454  normal  0.417051 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1519  acetoacetyl-CoA reductase  52.82 
 
 
247 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.004615  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2322  hypothetical protein  48.19 
 
 
247 aa  246  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02411  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.96 
 
 
246 aa  246  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  49.39 
 
 
241 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1056  hypothetical protein  47.79 
 
 
247 aa  246  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3362  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.96 
 
 
246 aa  244  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155625  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0283  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.56 
 
 
246 aa  240  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0254  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.56 
 
 
246 aa  240  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  48.98 
 
 
241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0620  hypothetical protein  50.85 
 
 
246 aa  238  5e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  46.31 
 
 
240 aa  238  5.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 
241 aa  238  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  48.16 
 
 
248 aa  238  9e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2305  hypothetical protein  48.59 
 
 
246 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>