More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4287 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  100 
 
 
248 aa  507  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  99.19 
 
 
248 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  92.74 
 
 
248 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  74.9 
 
 
248 aa  394  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  73.68 
 
 
248 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  73.68 
 
 
248 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  73.68 
 
 
248 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  73.68 
 
 
248 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  73.68 
 
 
248 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  73.68 
 
 
248 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  71.26 
 
 
248 aa  387  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  73.28 
 
 
248 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  62.3 
 
 
277 aa  341  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  62.75 
 
 
248 aa  337  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  62.3 
 
 
247 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  62.3 
 
 
247 aa  332  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  62.3 
 
 
247 aa  330  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  62.3 
 
 
247 aa  330  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  62.14 
 
 
247 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  61.73 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  61.73 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  61.48 
 
 
247 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  60.89 
 
 
248 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  60.89 
 
 
248 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  61.7 
 
 
236 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  60.43 
 
 
236 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  58.85 
 
 
246 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  59.43 
 
 
249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  57.2 
 
 
246 aa  299  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  55.92 
 
 
251 aa  295  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  59.26 
 
 
248 aa  293  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  57.72 
 
 
248 aa  288  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  56.56 
 
 
248 aa  286  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  57.32 
 
 
248 aa  286  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  52.02 
 
 
247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1198  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  57.61 
 
 
249 aa  270  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1633  acetyacetyl-CoA reductase  53.5 
 
 
246 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.389319 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.65 
 
 
245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  52.24 
 
 
246 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.67 
 
 
244 aa  264  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
260 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
246 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
246 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  52.26 
 
 
246 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
246 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  50.2 
 
 
248 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  53.09 
 
 
246 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
246 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
246 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
246 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.87 
 
 
245 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.84 
 
 
245 aa  262  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.65 
 
 
245 aa  260  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 
246 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.84 
 
 
245 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 
246 aa  258  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 
246 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  50.82 
 
 
246 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 
246 aa  256  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.02 
 
 
245 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.43 
 
 
245 aa  254  9e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.2 
 
 
245 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0557  acetoacetyl-CoA reductase  54.25 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.306822  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.61 
 
 
245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  50.2 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  50.2 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  49.8 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  49.8 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  49.8 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.85 
 
 
241 aa  252  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 
241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  49.39 
 
 
246 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  49.39 
 
 
246 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  54.32 
 
 
240 aa  250  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 
241 aa  249  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.05 
 
 
245 aa  249  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.18 
 
 
246 aa  248  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  52.24 
 
 
242 aa  248  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.5 
 
 
240 aa  248  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3061  acetoacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 
241 aa  246  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109458  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2467  acetoacetyl-CoA reductase  52.26 
 
 
241 aa  245  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4345  acetoacetyl CoA reductase; poly-beta-hydroxybutyrate biosynthesis  51.65 
 
 
241 aa  241  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  49.8 
 
 
242 aa  241  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  49.8 
 
 
242 aa  241  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3689  acetoacetyl-CoA reductase  49.79 
 
 
241 aa  241  9e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0508  acetoacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 
241 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2027  acetoacetyl-CoA reductase  51.87 
 
 
241 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  49.6 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  48.76 
 
 
241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0305  acetoacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 
241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108778  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  49.38 
 
 
240 aa  239  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4149  acetoacetyl-CoA reductase  51.42 
 
 
241 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.738636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0505  acetoacetyl-CoA reductase  50.21 
 
 
241 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2402  acetoacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 
240 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0747  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.85 
 
 
240 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02411  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.56 
 
 
246 aa  236  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  49.39 
 
 
242 aa  235  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  50.2 
 
 
242 aa  234  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  48.99 
 
 
242 aa  234  9e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>